Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4007960	4008044	85	35 [0]	[0] 63	yhiJ	hypothetical protein

GCATGTTACCAACTTCACTAAAGAACTGTTTGGGTATATTGCAAATGGTATAGGTGATGATA  >  W3110S.gb/4007898‑4007959                                                              | gCATGTTACCAACTTCACTAAAGAACTGTTTGGGTATATTGCAAATGGTATAGGTGATGata  <  1:571307/62‑1 (MQ=255) gCATGTTACCAACTTCACTAAAGAACTGTTTGGGTATATTGCAAATGGTATAGGTGATGata  <  1:337553/62‑1 (MQ=255) gCATGTTACCAACTTCACTAAAGAACTGTTTGGGTATATTGCAAATGGTATAGGTGATGata  <  1:375763/62‑1 (MQ=255) gCATGTTACCAACTTCACTAAAGAACTGTTTGGGTATATTGCAAATGGTATAGGTGATGata  <  1:396061/62‑1 (MQ=255) gCATGTTACCAACTTCACTAAAGAACTGTTTGGGTATATTGCAAATGGTATAGGTGATGata  <  1:427265/62‑1 (MQ=255) gCATGTTACCAACTTCACTAAAGAACTGTTTGGGTATATTGCAAATGGTATAGGTGATGata  <  1:463379/62‑1 (MQ=255) gCATGTTACCAACTTCACTAAAGAACTGTTTGGGTATATTGCAAATGGTATAGGTGATGata  <  1:544604/62‑1 (MQ=255) gCATGTTACCAACTTCACTAAAGAACTGTTTGGGTATATTGCAAATGGTATAGGTGATGata  <  1:548307/62‑1 (MQ=255) gCATGTTACCAACTTCACTAAAGAACTGTTTGGGTATATTGCAAATGGTATAGGTGATGata  <  1:567818/62‑1 (MQ=255) gCATGTTACCAACTTCACTAAAGAACTGTTTGGGTATATTGCAAATGGTATAGGTGATGata  <  1:332669/62‑1 (MQ=255) gCATGTTACCAACTTCACTAAAGAACTGTTTGGGTATATTGCAAATGGTATAGGTGATGata  <  1:625439/62‑1 (MQ=255) gCATGTTACCAACTTCACTAAAGAACTGTTTGGGTATATTGCAAATGGTATAGGTGATGata  <  1:642817/62‑1 (MQ=255) gCATGTTACCAACTTCACTAAAGAACTGTTTGGGTATATTGCAAATGGTATAGGTGATGata  <  1:658802/62‑1 (MQ=255) gCATGTTACCAACTTCACTAAAGAACTGTTTGGGTATATTGCAAATGGTATAGGTGATGata  <  1:741308/62‑1 (MQ=255) gCATGTTACCAACTTCACTAAAGAACTGTTTGGGTATATTGCAAATGGTATAGGTGATGata  <  1:771846/62‑1 (MQ=255) gCATGTTACCAACTTCACTAAAGAACTGTTTGGGTATATTGCAAATGGTATAGGTGATGata  <  1:826056/62‑1 (MQ=255) gCATGTTACCAACTTCACTAAAGAACTGTTTGGGTATATTGCAAATGGTATAGGTGATGata  <  1:916906/62‑1 (MQ=255) gCATGTTACCAACTTCACTAAAGAACTGTTTGGGTATATTGCAAATGGTATAGGTGATGata  <  1:317066/62‑1 (MQ=255) gCATGTTACCAACTTCACTAAAGAACTGTTTGGGTATATTGCAAATGGTATAGGTGATGata  <  1:1053044/62‑1 (MQ=255) gCATGTTACCAACTTCACTAAAGAACTGTTTGGGTATATTGCAAATGGTATAGGTGATGata  <  1:1110340/62‑1 (MQ=255) gCATGTTACCAACTTCACTAAAGAACTGTTTGGGTATATTGCAAATGGTATAGGTGATGata  <  1:1151705/62‑1 (MQ=255) gCATGTTACCAACTTCACTAAAGAACTGTTTGGGTATATTGCAAATGGTATAGGTGATGata  <  1:1162851/62‑1 (MQ=255) gCATGTTACCAACTTCACTAAAGAACTGTTTGGGTATATTGCAAATGGTATAGGTGATGata  <  1:1190531/62‑1 (MQ=255) gCATGTTACCAACTTCACTAAAGAACTGTTTGGGTATATTGCAAATGGTATAGGTGATGata  <  1:1234256/62‑1 (MQ=255) gCATGTTACCAACTTCACTAAAGAACTGTTTGGGTATATTGCAAATGGTATAGGTGATGata  <  1:1267869/62‑1 (MQ=255) gCATGTTACCAACTTCACTAAAGAACTGTTTGGGTATATTGCAAATGGTATAGGTGATGata  <  1:1279304/62‑1 (MQ=255) gCATGTTACCAACTTCACTAAAGAACTGTTTGGGTATATTGCAAATGGTATAGGTGATGata  <  1:1373003/62‑1 (MQ=255) gCATGTTACCAACTTCACTAAAGAACTGTTTGGGTATATTGCAAATGGTATAGGTGATGata  <  1:1404433/62‑1 (MQ=255) gCATGTTACCAACTTCACTAAAGAACTGTTTGGGTATATTGCAAATGGTATAGGTGATGata  <  1:196026/62‑1 (MQ=255) gCATGTTACCAACTTCACTAAAGAACTGTTTGGGTATATTGCAAATGGTATAGGTGATGata  <  1:273443/62‑1 (MQ=255) gCATGTTACCAACTTCACTAAAGAACTGTTTGGGTATATTGCAAATGGTATAGGTGATGata  <  1:302010/62‑1 (MQ=255) gCATGTTACCAACTTCACTAAAGAACTGTTTGGGTATATTGCAAATGGTATAGGTGATGata  <  1:1000669/62‑1 (MQ=255) gCATGCTACCAACTTCACTAAAGAACTGTTTGGGTATATTGCAAATGGTATAGGTGATGata  <  1:102771/62‑1 (MQ=255)  cATGTTACCAACTTCACTAAAGAACTGTTTGGGTATATTGCAAATGGTATAGGTGATGata  <  1:1448066/61‑1 (MQ=255)           aaCTTCACTAAAGAACTGTTTGGGTATATTGCAAATTGTATAGGTGATGata  <  1:342263/52‑1 (MQ=255)                                                              | GCATGTTACCAACTTCACTAAAGAACTGTTTGGGTATATTGCAAATGGTATAGGTGATGATA  >  W3110S.gb/4007898‑4007959

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑