Missing coverage evidence...
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GACAACATTACTACCCGTTTTCACTAAGCCTTCCCCGTTGGCGCTCAATGCTCTGCGCGCT  >  W3110S.gb/4009644‑4009704                                                             | gaCAACATTACTACCCGTTTTCACTAAGCCTTCCCCGTTGTCGCTCAATGCTCTGCGCGCt  <  1:1406386/61‑1 (MQ=255) gaCAACATTACTACCCGTTTTCACTAAGCCTTCCCCGTTGGCGCTCAATGCTCTGCGCGCt  <  1:742427/61‑1 (MQ=255) gaCAACATTACTACCCGTTTTCACTAAGCCTTCCCCGTTGGCGCTCAATGCTCTGCGCGCt  <  1:524478/61‑1 (MQ=255) gaCAACATTACTACCCGTTTTCACTAAGCCTTCCCCGTTGGCGCTCAATGCTCTGCGCGCt  <  1:52844/61‑1 (MQ=255) gaCAACATTACTACCCGTTTTCACTAAGCCTTCCCCGTTGGCGCTCAATGCTCTGCGCGCt  <  1:57259/61‑1 (MQ=255) gaCAACATTACTACCCGTTTTCACTAAGCCTTCCCCGTTGGCGCTCAATGCTCTGCGCGCt  <  1:602485/61‑1 (MQ=255) gaCAACATTACTACCCGTTTTCACTAAGCCTTCCCCGTTGGCGCTCAATGCTCTGCGCGCt  <  1:616721/61‑1 (MQ=255) gaCAACATTACTACCCGTTTTCACTAAGCCTTCCCCGTTGGCGCTCAATGCTCTGCGCGCt  <  1:621368/61‑1 (MQ=255) gaCAACATTACTACCCGTTTTCACTAAGCCTTCCCCGTTGGCGCTCAATGCTCTGCGCGCt  <  1:653307/61‑1 (MQ=255) gaCAACATTACTACCCGTTTTCACTAAGCCTTCCCCGTTGGCGCTCAATGCTCTGCGCGCt  <  1:698678/61‑1 (MQ=255) gaCAACATTACTACCCGTTTTCACTAAGCCTTCCCCGTTGGCGCTCAATGCTCTGCGCGCt  <  1:699439/61‑1 (MQ=255) gaCAACATTACTACCCGTTTTCACTAAGCCTTCCCCGTTGGCGCTCAATGCTCTGCGCGCt  <  1:465913/61‑1 (MQ=255) gaCAACATTACTACCCGTTTTCACTAAGCCTTCCCCGTTGGCGCTCAATGCTCTGCGCGCt  <  1:743769/61‑1 (MQ=255) gaCAACATTACTACCCGTTTTCACTAAGCCTTCCCCGTTGGCGCTCAATGCTCTGCGCGCt  <  1:773325/61‑1 (MQ=255) gaCAACATTACTACCCGTTTTCACTAAGCCTTCCCCGTTGGCGCTCAATGCTCTGCGCGCt  <  1:834717/61‑1 (MQ=255) gaCAACATTACTACCCGTTTTCACTAAGCCTTCCCCGTTGGCGCTCAATGCTCTGCGCGCt  <  1:872463/61‑1 (MQ=255) gaCAACATTACTACCCGTTTTCACTAAGCCTTCCCCGTTGGCGCTCAATGCTCTGCGCGCt  <  1:880084/61‑1 (MQ=255) gaCAACATTACTACCCGTTTTCACTAAGCCTTCCCCGTTGGCGCTCAATGCTCTGCGCGCt  <  1:880734/61‑1 (MQ=255) gaCAACATTACTACCCGTTTTCACTAAGCCTTCCCCGTTGGCGCTCAATGCTCTGCGCGCt  <  1:904664/61‑1 (MQ=255) gaCAACATTACTACCCGTTTTCACTAAGCCTTCCCCGTTGGCGCTCAATGCTCTGCGCGCt  <  1:906801/61‑1 (MQ=255) gaCAACATTACTACCCGTTTTCACTAAGCCTTCCCCGTTGGCGCTCAATGCTCTGCGCGCt  <  1:926163/61‑1 (MQ=255) gaCAACATTACTACCCGTTTTCACTAAGCCTTCCCCGTTGGCGCTCAATGCTCTGCGCGCt  <  1:96376/61‑1 (MQ=255) gaCAACATTACTACCCGTTTTCACTAAGCCTTCCCCGTTGGCGCTCAATGCTCTGCGCGCt  <  1:1378188/61‑1 (MQ=255) gaCAACATTACTACCCGTTTTCACTAAGCCTTCCCCGTTGGCGCTCAATGCTCTGCGCGCt  <  1:1061913/61‑1 (MQ=255) gaCAACATTACTACCCGTTTTCACTAAGCCTTCCCCGTTGGCGCTCAATGCTCTGCGCGCt  <  1:1075647/61‑1 (MQ=255) gaCAACATTACTACCCGTTTTCACTAAGCCTTCCCCGTTGGCGCTCAATGCTCTGCGCGCt  <  1:1127286/61‑1 (MQ=255) gaCAACATTACTACCCGTTTTCACTAAGCCTTCCCCGTTGGCGCTCAATGCTCTGCGCGCt  <  1:1135681/61‑1 (MQ=255) gaCAACATTACTACCCGTTTTCACTAAGCCTTCCCCGTTGGCGCTCAATGCTCTGCGCGCt  <  1:118070/61‑1 (MQ=255) gaCAACATTACTACCCGTTTTCACTAAGCCTTCCCCGTTGGCGCTCAATGCTCTGCGCGCt  <  1:1279713/61‑1 (MQ=255) gaCAACATTACTACCCGTTTTCACTAAGCCTTCCCCGTTGGCGCTCAATGCTCTGCGCGCt  <  1:1319488/61‑1 (MQ=255) gaCAACATTACTACCCGTTTTCACTAAGCCTTCCCCGTTGGCGCTCAATGCTCTGCGCGCt  <  1:1337737/61‑1 (MQ=255) gaCAACATTACTACCCGTTTTCACTAAGCCTTCCCCGTTGGCGCTCAATGCTCTGCGCGCt  <  1:469709/61‑1 (MQ=255) gaCAACATTACTACCCGTTTTCACTAAGCCTTCCCCGTTGGCGCTCAATGCTCTGCGCGCt  <  1:181637/61‑1 (MQ=255) gaCAACATTACTACCCGTTTTCACTAAGCCTTCCCCGTTGGCGCTCAATGCTCTGCGCGCt  <  1:231628/61‑1 (MQ=255) gaCAACATTACTACCCGTTTTCACTAAGCCTTCCCCGTTGGCGCTCAATGCTCTGCGCGCt  <  1:251422/61‑1 (MQ=255) gaCAACATTACTACCCGTTTTCACTAAGCCTTCCCCGTTGGCGCTCAATGCTCTGCGCGCt  <  1:257001/61‑1 (MQ=255) gaCAACATTACTACCCGTTTTCACTAAGCCTTCCCCGTTGGCGCTCAATGCTCTGCGCGCt  <  1:278009/61‑1 (MQ=255) gaCAACATTACTACCCGTTTTCACTAAGCCTTCCCCGTTGGCGCTCAATGCTCTGCGCGCt  <  1:283365/61‑1 (MQ=255) gaCAACATTACTACCCGTTTTCACTAAGCCTTCCCCGTTGGCGCTCAATGCTCTGCGCGCt  <  1:350912/61‑1 (MQ=255) gaCAACATTACTACCCGTTTTCACTAAGCCTTCCCCGTTGGCGCTCAATGCTCTGCGCGCt  <  1:1038499/61‑1 (MQ=255) gaCAACATTACTACCCGTTTTCACTAAGCCTTCCCCGTTGGCGCTCAACGCTCTGCGCGCt  <  1:122671/61‑1 (MQ=255)             acCCGTTTTCACTAAGCCTTCCCCGTTGGCGCTCAATGCTCTGCGCGCt  <  1:1388259/49‑1 (MQ=255)                           aGCCTTCCCCGTGGGCGCTCAATGCTCTGCGCGCt  <  1:1234984/35‑1 (MQ=255)                                                             | GACAACATTACTACCCGTTTTCACTAAGCCTTCCCCGTTGGCGCTCAATGCTCTGCGCGCT  >  W3110S.gb/4009644‑4009704

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑