Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4057865	4058027	163	22 [0]	[0] 11	yhhZ	conserved hypothetical protein

AGTTTGCCTAAGTAACTATTTATTTCTGTATATGTATCAACATTAGAACGCTTTGTTAA  >  W3110S.gb/4057806‑4057864                                                           | aGTTTGCCTAAGTAACTATTTATTTCTGTATATGTATCAACATTAGAACGCTTTGTTaa  <  1:642885/59‑1 (MQ=255) aGTTTGCCTAAGTAACTATTTATTTCTGTATATGTATCAACATTAGAACGCTTTGTTaa  <  1:983764/59‑1 (MQ=255) aGTTTGCCTAAGTAACTATTTATTTCTGTATATGTATCAACATTAGAACGCTTTGTTaa  <  1:978921/59‑1 (MQ=255) aGTTTGCCTAAGTAACTATTTATTTCTGTATATGTATCAACATTAGAACGCTTTGTTaa  <  1:977663/59‑1 (MQ=255) aGTTTGCCTAAGTAACTATTTATTTCTGTATATGTATCAACATTAGAACGCTTTGTTaa  <  1:943316/59‑1 (MQ=255) aGTTTGCCTAAGTAACTATTTATTTCTGTATATGTATCAACATTAGAACGCTTTGTTaa  <  1:858323/59‑1 (MQ=255) aGTTTGCCTAAGTAACTATTTATTTCTGTATATGTATCAACATTAGAACGCTTTGTTaa  <  1:79985/59‑1 (MQ=255) aGTTTGCCTAAGTAACTATTTATTTCTGTATATGTATCAACATTAGAACGCTTTGTTaa  <  1:706705/59‑1 (MQ=255) aGTTTGCCTAAGTAACTATTTATTTCTGTATATGTATCAACATTAGAACGCTTTGTTaa  <  1:672377/59‑1 (MQ=255) aGTTTGCCTAAGTAACTATTTATTTCTGTATATGTATCAACATTAGAACGCTTTGTTaa  <  1:650411/59‑1 (MQ=255) aGTTTGCCTAAGTAACTATTTATTTCTGTATATGTATCAACATTAGAACGCTTTGTTaa  <  1:1062883/59‑1 (MQ=255) aGTTTGCCTAAGTAACTATTTATTTCTGTATATGTATCAACATTAGAACGCTTTGTTaa  <  1:638485/59‑1 (MQ=255) aGTTTGCCTAAGTAACTATTTATTTCTGTATATGTATCAACATTAGAACGCTTTGTTaa  <  1:588866/59‑1 (MQ=255) aGTTTGCCTAAGTAACTATTTATTTCTGTATATGTATCAACATTAGAACGCTTTGTTaa  <  1:518390/59‑1 (MQ=255) aGTTTGCCTAAGTAACTATTTATTTCTGTATATGTATCAACATTAGAACGCTTTGTTaa  <  1:494987/59‑1 (MQ=255) aGTTTGCCTAAGTAACTATTTATTTCTGTATATGTATCAACATTAGAACGCTTTGTTaa  <  1:40485/59‑1 (MQ=255) aGTTTGCCTAAGTAACTATTTATTTCTGTATATGTATCAACATTAGAACGCTTTGTTaa  <  1:373467/59‑1 (MQ=255) aGTTTGCCTAAGTAACTATTTATTTCTGTATATGTATCAACATTAGAACGCTTTGTTaa  <  1:324548/59‑1 (MQ=255) aGTTTGCCTAAGTAACTATTTATTTCTGTATATGTATCAACATTAGAACGCTTTGTTaa  <  1:252619/59‑1 (MQ=255) aGTTTGCCTAAGTAACTATTTATTTCTGTATATGTATCAACATTAGAACGCTTTGTTaa  <  1:1298656/59‑1 (MQ=255) aGTTTGCCTAAGTAACTATTTATTTCTGTATATGTATCAACATTAGAACGCTTTGTTaa  <  1:1202247/59‑1 (MQ=255)  gTTTGCCTAAGTAACTATTTATTTCTGTATATGTATCAACATTAGAACGCTTTGTTaa  <  1:814739/58‑1 (MQ=255)                                                           | AGTTTGCCTAAGTAACTATTTATTTCTGTATATGTATCAACATTAGAACGCTTTGTTAA  >  W3110S.gb/4057806‑4057864

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑