Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	5934	5974	41	60 [0]	[0] 24	yaaA	conserved hypothetical protein

TCATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTAA  >  W3110S.gb/5873‑5933                                                             | tcATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:1019926/61‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:242537/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:995107/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:323114/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:367678/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:424110/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:484456/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:519168/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:567035/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:597234/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:610844/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:616858/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:632267/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:632340/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:667108/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:706486/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:721195/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:754792/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:759585/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:776611/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:779343/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:796946/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:83813/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:852685/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:862126/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:868146/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:897670/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:906011/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:987787/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:1008823/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:1286159/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:1025065/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:1025433/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:1030883/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:1085382/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:1112051/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:1117398/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:1131468/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:1148339/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:1156676/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:1176341/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:1191476/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:1248791/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:1252829/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:1280778/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:225743/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:1290336/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:1307407/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:1308409/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:1331302/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:1337275/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:1354536/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:1371375/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:1382949/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:1394167/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:1423839/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:1451264/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:194477/60‑1 (MQ=255)  cATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:198080/60‑1 (MQ=255)           acacCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTaa  <  1:658728/51‑1 (MQ=255)                                                             | TCATCGAGGAACACCGGCTTGATAATCTCGGCATTCAATTTCTTCGGCTTCACCGATTTAA  >  W3110S.gb/5873‑5933

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑