Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	6037	6140	104	24 [1]	[3] 11	yaaA	conserved hypothetical protein

TGTGCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGTGATGATATCTCCCCAGAATTGATACAGATCT  >  W3110S.gb/5975‑6037                                                              |  tgtgCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGTGATGATATCTCCCCAGAATTGATACAGATc   >  1:442019/1‑62 (MQ=255) tgtgCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGTGATGATATCTCCCCAGAATTGATACAGATc   >  1:925507/1‑62 (MQ=255) tgtgCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGTGATGATATCTCCCCAGAATTGATACAGATc   >  1:912063/1‑62 (MQ=255) tgtgCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGTGATGATATCTCCCCAGAATTGATACAGATc   >  1:810636/1‑62 (MQ=255) tgtgCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGTGATGATATCTCCCCAGAATTGATACAGATc   >  1:802343/1‑62 (MQ=255) tgtgCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGTGATGATATCTCCCCAGAATTGATACAGATc   >  1:793844/1‑62 (MQ=255) tgtgCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGTGATGATATCTCCCCAGAATTGATACAGATc   >  1:68353/1‑62 (MQ=255) tgtgCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGTGATGATATCTCCCCAGAATTGATACAGATc   >  1:596552/1‑62 (MQ=255) tgtgCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGTGATGATATCTCCCCAGAATTGATACAGATc   >  1:594187/1‑62 (MQ=255) tgtgCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGTGATGATATCTCCCCAGAATTGATACAGATc   >  1:554200/1‑62 (MQ=255) tgtgCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGTGATGATATCTCCCCAGAATTGATACAGATc   >  1:546746/1‑62 (MQ=255) tgtgCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGTGATGATATCTCCCCAGAATTGATACAGATc   >  1:511859/1‑62 (MQ=255) tgtgCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGTGATGATATCTCCCCAGAATTGATACAGATc   >  1:1031962/1‑62 (MQ=255) tgtgCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGTGATGATATCTCCCCAGAATTGATACAGATc   >  1:311812/1‑62 (MQ=255) tgtgCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGTGATGATATCTCCCCAGAATTGATACAGATc   >  1:1459230/1‑62 (MQ=255) tgtgCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGTGATGATATCTCCCCAGAATTGATACAGATc   >  1:1373842/1‑62 (MQ=255) tgtgCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGTGATGATATCTCCCCAGAATTGATACAGATc   >  1:1262358/1‑62 (MQ=255) tgtgCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGTGATGATATCTCCCCAGAATTGATACAGATc   >  1:1248536/1‑62 (MQ=255) tgtgCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGTGATGATATCTCCCCAGAATTGATACAGATc   >  1:1180415/1‑62 (MQ=255) tgtgCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGTGATGATATCTCCCCAGAATTGATACAGATc   >  1:1178696/1‑62 (MQ=255) tgtgCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGTGATGATATCTCCCCAGAATTGATACAGATc   >  1:1115209/1‑62 (MQ=255) tgtgCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGTGATGATATCTCCCCAGAATTGATACAGATc   >  1:1111592/1‑62 (MQ=255) tgtgCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGTGATGATATCTCCCCAGAATTGATACAGATc   >  1:1096726/1‑62 (MQ=255) tgtgCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGTGATGATATCT‑CCCAGAATTGATACAGATCt  >  1:298602/1‑62 (MQ=255)                                                              |  TGTGCTGCGAGCGCCTCGTTCAGCTTGTTGGTGATGATATCTCCCCAGAATTGATACAGATCT  >  W3110S.gb/5975‑6037

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑