Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4069559	4069579	21	34 [0]	[0] 21	glgX	glycogen debranching enzyme

GATCACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTA  >  W3110S.gb/4069497‑4069558                                                              | gATCACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTa  <  1:884918/62‑1 (MQ=255) gATCACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTa  <  1:566781/62‑1 (MQ=255) gATCACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTa  <  1:475448/62‑1 (MQ=255) gATCACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTa  <  1:639534/62‑1 (MQ=255) gATCACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTa  <  1:288144/62‑1 (MQ=255) gATCACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTa  <  1:175362/62‑1 (MQ=255) gATCACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTa  <  1:80752/62‑1 (MQ=255) gATCACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTa  <  1:1368114/62‑1 (MQ=255) gATCACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTa  <  1:1251769/62‑1 (MQ=255) gATCACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTa  <  1:1227149/62‑1 (MQ=255) gATCACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTa  <  1:1136161/62‑1 (MQ=255) gATCACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTa  <  1:1071858/62‑1 (MQ=255) gATCACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTa  <  1:1020227/62‑1 (MQ=255) gATCACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTa  <  1:102481/62‑1 (MQ=255) gATCACTATGACTGGGAACATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTa  <  1:1060655/62‑1 (MQ=255)  aTCACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCCCGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTa  >  1:654214/1‑61 (MQ=255)  aTCACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTa  >  1:989335/1‑61 (MQ=255)  aTCACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTa  >  1:912959/1‑61 (MQ=255)  aTCACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTa  >  1:946355/1‑61 (MQ=255)  aTCACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTa  >  1:705282/1‑61 (MQ=255)  aTCACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTa  >  1:670995/1‑61 (MQ=255)  aTCACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTa  >  1:662083/1‑61 (MQ=255)  aTCACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTa  >  1:580687/1‑61 (MQ=255)  aTCACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTa  >  1:422704/1‑61 (MQ=255)  aTCACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTa  >  1:398277/1‑61 (MQ=255)  aTCACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTa  >  1:345542/1‑61 (MQ=255)  aTCACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTa  >  1:288223/1‑61 (MQ=255)  aTCACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTa  >  1:196643/1‑61 (MQ=255)  aTCACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTa  >  1:1390038/1‑61 (MQ=255)  aTCACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTa  >  1:1373573/1‑61 (MQ=255)  aTCACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTa  >  1:1097806/1‑61 (MQ=255)  aTCACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTa  >  1:1086047/1‑61 (MQ=255)  aTCACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTa  >  1:1068220/1‑61 (MQ=255)  aTCACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACAATCATTTa  >  1:807649/1‑61 (MQ=255)                                                              | GATCACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTA  >  W3110S.gb/4069497‑4069558

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑