Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4084593	4084612	20	43 [0]	[0] 44	rtcA/malT	RNA 3'‑terminal phosphate cyclase/DNA‑binding transcriptional activator, maltotriose‑ATP‑binding

GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCAGAG  >  W3110S.gb/4084531‑4084592                                                              | ggTGCGGTTTAGTTTGATAGAATCAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGATTGATGCagag  >  1:1088351/1‑62 (MQ=255) ggTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCagag  >  1:792116/1‑62 (MQ=255) ggTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCagag  >  1:620129/1‑62 (MQ=255) ggTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCagag  >  1:629479/1‑62 (MQ=255) ggTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCagag  >  1:632568/1‑62 (MQ=255) ggTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCagag  >  1:671124/1‑62 (MQ=255) ggTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCagag  >  1:674239/1‑62 (MQ=255) ggTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCagag  >  1:680426/1‑62 (MQ=255) ggTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCagag  >  1:689685/1‑62 (MQ=255) ggTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCagag  >  1:699245/1‑62 (MQ=255) ggTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCagag  >  1:708826/1‑62 (MQ=255) ggTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCagag  >  1:741089/1‑62 (MQ=255) ggTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCagag  >  1:508174/1‑62 (MQ=255) ggTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCagag  >  1:800283/1‑62 (MQ=255) ggTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCagag  >  1:834816/1‑62 (MQ=255) ggTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCagag  >  1:845582/1‑62 (MQ=255) ggTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCagag  >  1:866913/1‑62 (MQ=255) ggTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCagag  >  1:874135/1‑62 (MQ=255) ggTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCagag  >  1:876539/1‑62 (MQ=255) ggTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCagag  >  1:884746/1‑62 (MQ=255) ggTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCagag  >  1:905736/1‑62 (MQ=255) ggTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCagag  >  1:993911/1‑62 (MQ=255) ggTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCagag  >  1:1340860/1‑62 (MQ=255) ggTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCagag  >  1:1029238/1‑62 (MQ=255) ggTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCagag  >  1:106313/1‑62 (MQ=255) ggTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCagag  >  1:1160878/1‑62 (MQ=255) ggTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCagag  >  1:1185128/1‑62 (MQ=255) ggTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCagag  >  1:1259942/1‑62 (MQ=255) ggTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCagag  >  1:1270224/1‑62 (MQ=255) ggTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCagag  >  1:1283523/1‑62 (MQ=255) ggTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCagag  >  1:1290634/1‑62 (MQ=255) ggTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCagag  >  1:1310003/1‑62 (MQ=255) ggTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCagag  >  1:132479/1‑62 (MQ=255) ggTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCagag  >  1:589219/1‑62 (MQ=255) ggTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCagag  >  1:13899/1‑62 (MQ=255) ggTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCagag  >  1:1445366/1‑62 (MQ=255) ggTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCagag  >  1:1471942/1‑62 (MQ=255) ggTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCagag  >  1:220789/1‑62 (MQ=255) ggTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCagag  >  1:348213/1‑62 (MQ=255) ggTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCagag  >  1:354979/1‑62 (MQ=255) ggTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCagag  >  1:456055/1‑62 (MQ=255) ggTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCagag  >  1:506402/1‑62 (MQ=255) ggTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCagag  >  1:1026089/1‑62 (MQ=255)                                                              | GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCAGAG  >  W3110S.gb/4084531‑4084592

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑