Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4104663	4104786	124	19 [0]	[0] 12	envZ	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with OmpR

TCATCGTCACCTTGCTGTTCGCCAGCCTGGTGACGACTTATCTGGTGGTGCTGAACTTCGC  >  W3110S.gb/4104602‑4104662                                                             | tCATCGTCACCTTGCTGTTCGCCAGCCTGGTGACGACTTATCTGGTGGTGCTGAACTTcgc  <  1:1315202/61‑1 (MQ=255) tCATCGTCACCTTGCTGTTCGCCAGCCTGGTGACGACTTATCTGGTGGTGCTGAACTTcgc  <  1:95112/61‑1 (MQ=255) tCATCGTCACCTTGCTGTTCGCCAGCCTGGTGACGACTTATCTGGTGGTGCTGAACTTcgc  <  1:857896/61‑1 (MQ=255) tCATCGTCACCTTGCTGTTCGCCAGCCTGGTGACGACTTATCTGGTGGTGCTGAACTTcgc  <  1:812043/61‑1 (MQ=255) tCATCGTCACCTTGCTGTTCGCCAGCCTGGTGACGACTTATCTGGTGGTGCTGAACTTcgc  <  1:792437/61‑1 (MQ=255) tCATCGTCACCTTGCTGTTCGCCAGCCTGGTGACGACTTATCTGGTGGTGCTGAACTTcgc  <  1:714431/61‑1 (MQ=255) tCATCGTCACCTTGCTGTTCGCCAGCCTGGTGACGACTTATCTGGTGGTGCTGAACTTcgc  <  1:521107/61‑1 (MQ=255) tCATCGTCACCTTGCTGTTCGCCAGCCTGGTGACGACTTATCTGGTGGTGCTGAACTTcgc  <  1:397727/61‑1 (MQ=255) tCATCGTCACCTTGCTGTTCGCCAGCCTGGTGACGACTTATCTGGTGGTGCTGAACTTcgc  <  1:33734/61‑1 (MQ=255) tCATCGTCACCTTGCTGTTCGCCAGCCTGGTGACGACTTATCTGGTGGTGCTGAACTTcgc  <  1:288919/61‑1 (MQ=255) tCATCGTCACCTTGCTGTTCGCCAGCCTGGTGACGACTTATCTGGTGGTGCTGAACTTcgc  <  1:231958/61‑1 (MQ=255) tCATCGTCACCTTGCTGTTCGCCAGCCTGGTGACGACTTATCTGGTGGTGCTGAACTTcgc  <  1:173354/61‑1 (MQ=255) tCATCGTCACCTTGCTGTTCGCCAGCCTGGTGACGACTTATCTGGTGGTGCTGAACTTcgc  <  1:150652/61‑1 (MQ=255) tCATCGTCACCTTGCTGTTCGCCAGCCTGGTGACGACTTATCTGGTGGTGCTGAACTTcgc  <  1:1414530/61‑1 (MQ=255) tCATCGTCACCTTGCTGTTCGCCAGCCTGGTGACGACTTATCTGGTGGTGCTGAACTTcgc  <  1:1406748/61‑1 (MQ=255) tCATCGTCACCTTGCTGTTCGCCAGCCTGGTGACGACTTATCTGGTGGTGCTGAACTTcgc  <  1:1216515/61‑1 (MQ=255) tCATCGTCACCTTGCTGTTCGCCAGCCTGGTCACGACTTATCTGGTGGTGCTGAACTTcgc  <  1:296591/61‑1 (MQ=255)  cATCGTCACCTTGCTGTTCGCCAGCCTGGTGACGACTTATCTGGTGGTGCTGAACTTcgc  <  1:762519/60‑1 (MQ=255)           cTTGCTGTTCGCCAGCCTGGTGACGACTTATCTGGTGGTGCTGAACTTcgc  <  1:1445332/51‑1 (MQ=255)                                                             | TCATCGTCACCTTGCTGTTCGCCAGCCTGGTGACGACTTATCTGGTGGTGCTGAACTTCGC  >  W3110S.gb/4104602‑4104662

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑