Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4123075	4123377	303	57 [1]	[0] 19	[damX]	[damX]

CAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTGC  >  W3110S.gb/4123013‑4123075                                                              |  cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGGCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:123719/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAATCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:922774/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAGTTg   <  1:1032029/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:778712/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:32024/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:40165/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:405911/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:409641/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:457746/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:550829/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:562102/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:598904/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:600055/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:607696/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:609338/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:616851/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:649901/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:733095/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:297427/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:783823/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:789215/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:796381/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:804134/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:813812/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:853913/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:91912/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:921673/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:936141/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:967270/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:142212/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:1185245/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:1222161/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:1225716/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:1250024/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:1261074/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:1286776/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:1326053/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:1373414/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:1384213/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:1404192/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:1012912/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:1420774/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:1444374/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:1558/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:198854/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:203223/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:229270/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:253719/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:1171009/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:25763/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:1107428/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:101942/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGATTCAGGTTAATTg   <  1:502219/62‑1 (MQ=255) cAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGCCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:1417360/62‑1 (MQ=255)  aGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTGc  >  1:293755/1‑62 (MQ=255)                         gCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:265465/38‑1 (MQ=255)                            gCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTg   <  1:449690/35‑1 (MQ=255)                                                              |  CAGCGTAACAACAAGAAAGGTCAGGCCGCTTATCAAGCGGTCTATTAGCTTCAGGTTAATTGC  >  W3110S.gb/4123013‑4123075

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑