Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4146484	4146832	349	42 [0]	[0] 7	[tsgA]	[tsgA]

TTTTCTATTACCGCCTACCTTAACGATTCAGCAACCCCGCTTATTGATGTAAATCAAATTC  >  W3110S.gb/4146423‑4146483                                                             | ttttctATTACCGCCTACCTTAACGATTCAGCAACCCCGCTTGTTGATGTAAATCAAATTc  <  1:338814/61‑1 (MQ=255) ttttctATTACCGCCTACCTTAACGATTCAGCAACCCCGCTTATTGATGTAAATCGAATTc  <  1:914952/61‑1 (MQ=255) ttttctATTACCGCCTACCTTAACGATTCAGCAACCCCGCTTATTGATGTAAATCAAATTc  <  1:670204/61‑1 (MQ=255) ttttctATTACCGCCTACCTTAACGATTCAGCAACCCCGCTTATTGATGTAAATCAAATTc  <  1:107902/61‑1 (MQ=255) ttttctATTACCGCCTACCTTAACGATTCAGCAACCCCGCTTATTGATGTAAATCAAATTc  <  1:329110/61‑1 (MQ=255) ttttctATTACCGCCTACCTTAACGATTCAGCAACCCCGCTTATTGATGTAAATCAAATTc  <  1:348129/61‑1 (MQ=255) ttttctATTACCGCCTACCTTAACGATTCAGCAACCCCGCTTATTGATGTAAATCAAATTc  <  1:420601/61‑1 (MQ=255) ttttctATTACCGCCTACCTTAACGATTCAGCAACCCCGCTTATTGATGTAAATCAAATTc  <  1:492937/61‑1 (MQ=255) ttttctATTACCGCCTACCTTAACGATTCAGCAACCCCGCTTATTGATGTAAATCAAATTc  <  1:515320/61‑1 (MQ=255) ttttctATTACCGCCTACCTTAACGATTCAGCAACCCCGCTTATTGATGTAAATCAAATTc  <  1:582682/61‑1 (MQ=255) ttttctATTACCGCCTACCTTAACGATTCAGCAACCCCGCTTATTGATGTAAATCAAATTc  <  1:650331/61‑1 (MQ=255) ttttctATTACCGCCTACCTTAACGATTCAGCAACCCCGCTTATTGATGTAAATCAAATTc  <  1:653550/61‑1 (MQ=255) ttttctATTACCGCCTACCTTAACGATTCAGCAACCCCGCTTATTGATGTAAATCAAATTc  <  1:241309/61‑1 (MQ=255) ttttctATTACCGCCTACCTTAACGATTCAGCAACCCCGCTTATTGATGTAAATCAAATTc  <  1:730474/61‑1 (MQ=255) ttttctATTACCGCCTACCTTAACGATTCAGCAACCCCGCTTATTGATGTAAATCAAATTc  <  1:86403/61‑1 (MQ=255) ttttctATTACCGCCTACCTTAACGATTCAGCAACCCCGCTTATTGATGTAAATCAAATTc  <  1:889650/61‑1 (MQ=255) ttttctATTACCGCCTACCTTAACGATTCAGCAACCCCGCTTATTGATGTAAATCAAATTc  <  1:90570/61‑1 (MQ=255) ttttctATTACCGCCTACCTTAACGATTCAGCAACCCCGCTTATTGATGTAAATCAAATTc  <  1:9506/61‑1 (MQ=255) ttttctATTACCGCCTACCTTAACGATTCAGCAACCCCGCTTATTGATGTAAATCAAATTc  <  1:956328/61‑1 (MQ=255) ttttctATTACCGCCTACCTTAACGATTCAGCAACCCCGCTTATTGATGTAAATCAAATTc  <  1:979094/61‑1 (MQ=255) ttttctATTACCGCCTACCTTAACGATTCAGCAACCCCGCTTATTGATGTAAATCAAATTc  <  1:993787/61‑1 (MQ=255) ttttctATTACCGCCTACCTTAACGATTCAGCAACCCCGCTTATTGATGTAAATCAAATTc  <  1:1304981/61‑1 (MQ=255) ttttctATTACCGCCTACCTTAACGATTCAGCAACCCCGCTTATTGATGTAAATCAAATTc  <  1:1079919/61‑1 (MQ=255) ttttctATTACCGCCTACCTTAACGATTCAGCAACCCCGCTTATTGATGTAAATCAAATTc  <  1:1106638/61‑1 (MQ=255) ttttctATTACCGCCTACCTTAACGATTCAGCAACCCCGCTTATTGATGTAAATCAAATTc  <  1:114966/61‑1 (MQ=255) ttttctATTACCGCCTACCTTAACGATTCAGCAACCCCGCTTATTGATGTAAATCAAATTc  <  1:1181480/61‑1 (MQ=255) ttttctATTACCGCCTACCTTAACGATTCAGCAACCCCGCTTATTGATGTAAATCAAATTc  <  1:1232063/61‑1 (MQ=255) ttttctATTACCGCCTACCTTAACGATTCAGCAACCCCGCTTATTGATGTAAATCAAATTc  <  1:1238526/61‑1 (MQ=255) ttttctATTACCGCCTACCTTAACGATTCAGCAACCCCGCTTATTGATGTAAATCAAATTc  <  1:1253240/61‑1 (MQ=255) ttttctATTACCGCCTACCTTAACGATTCAGCAACCCCGCTTATTGATGTAAATCAAATTc  <  1:1297094/61‑1 (MQ=255) ttttctATTACCGCCTACCTTAACGATTCAGCAACCCCGCTTATTGATGTAAATCAAATTc  <  1:166080/61‑1 (MQ=255) ttttctATTACCGCCTACCTTAACGATTCAGCAACCCCGCTTATTGATGTAAATCAAATTc  <  1:1331886/61‑1 (MQ=255) ttttctATTACCGCCTACCTTAACGATTCAGCAACCCCGCTTATTGATGTAAATCAAATTc  <  1:1358180/61‑1 (MQ=255) ttttctATTACCGCCTACCTTAACGATTCAGCAACCCCGCTTATTGATGTAAATCAAATTc  <  1:1375883/61‑1 (MQ=255) ttttctATTACCGCCTACCTTAACGATTCAGCAACCCCGCTTATTGATGTAAATCAAATTc  <  1:138372/61‑1 (MQ=255) ttttctATTACCGCCTACCTTAACGATTCAGCAACCCCGCTTATTGATGTAAATCAAATTc  <  1:1386500/61‑1 (MQ=255) ttttctATTACCGCCTACCTTAACGATTCAGCAACCCCGCTTATTGATGTAAATCAAATTc  <  1:1420244/61‑1 (MQ=255) ttttctATTACCGCCTACCTTAACGATTCAGCAACCCCGCTTATTGATGTAAATCAAATTc  <  1:1435727/61‑1 (MQ=255) ttttctATTACCGCCTACCTTAACGATTCAGCAACCCCGCTTATTGATGTAAATCAAATTc  <  1:1442561/61‑1 (MQ=255) ttttctATTACCGCCTACCTTAACGATTCAGCAACCCCGCTTATTGATGTAAATCAAATTc  <  1:163764/61‑1 (MQ=255)  tttctATTACCGCCTACCTTAACGATTCAGCAACCCCGCTTATTGATGTAAATCAAATTc  <  1:789389/60‑1 (MQ=255)             gCCTACCTTAACGATTCAGCAACCCCGCTTATTGATGTAAATCAAATTc  <  1:1209199/49‑1 (MQ=255)                                                             | TTTTCTATTACCGCCTACCTTAACGATTCAGCAACCCCGCTTATTGATGTAAATCAAATTC  >  W3110S.gb/4146423‑4146483

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑