Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4175725	4175922	198	42 [0]	[0] 16	gspL	general secretory pathway component, cryptic

TGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGCCAACAA  >  W3110S.gb/4175664‑4175724                                                             | tgCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCTCGATGCTCCGGCTGCcaacaa  <  1:1423740/61‑1 (MQ=255) tgCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGCcaacaa  <  1:485865/61‑1 (MQ=255) tgCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGCcaacaa  <  1:220592/61‑1 (MQ=255) tgCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGCcaacaa  <  1:222327/61‑1 (MQ=255) tgCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGCcaacaa  <  1:232737/61‑1 (MQ=255) tgCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGCcaacaa  <  1:294468/61‑1 (MQ=255) tgCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGCcaacaa  <  1:326070/61‑1 (MQ=255) tgCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGCcaacaa  <  1:332333/61‑1 (MQ=255) tgCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGCcaacaa  <  1:357739/61‑1 (MQ=255) tgCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGCcaacaa  <  1:413853/61‑1 (MQ=255) tgCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGCcaacaa  <  1:441412/61‑1 (MQ=255) tgCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGCcaacaa  <  1:1049807/61‑1 (MQ=255) tgCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGCcaacaa  <  1:558448/61‑1 (MQ=255) tgCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGCcaacaa  <  1:568946/61‑1 (MQ=255) tgCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGCcaacaa  <  1:596997/61‑1 (MQ=255) tgCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGCcaacaa  <  1:616463/61‑1 (MQ=255) tgCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGCcaacaa  <  1:651869/61‑1 (MQ=255) tgCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGCcaacaa  <  1:673007/61‑1 (MQ=255) tgCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGCcaacaa  <  1:75064/61‑1 (MQ=255) tgCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGCcaacaa  <  1:751513/61‑1 (MQ=255) tgCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGCcaacaa  <  1:785914/61‑1 (MQ=255) tgCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGCcaacaa  <  1:163687/61‑1 (MQ=255) tgCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGCcaacaa  <  1:1049039/61‑1 (MQ=255) tgCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGCcaacaa  <  1:1052141/61‑1 (MQ=255) tgCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGCcaacaa  <  1:105628/61‑1 (MQ=255) tgCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGCcaacaa  <  1:1062534/61‑1 (MQ=255) tgCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGCcaacaa  <  1:1095239/61‑1 (MQ=255) tgCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGCcaacaa  <  1:1142519/61‑1 (MQ=255) tgCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGCcaacaa  <  1:1148926/61‑1 (MQ=255) tgCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGCcaacaa  <  1:1248477/61‑1 (MQ=255) tgCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGCcaacaa  <  1:1354850/61‑1 (MQ=255) tgCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGCcaacaa  <  1:135517/61‑1 (MQ=255) tgCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGCcaacaa  <  1:1360347/61‑1 (MQ=255) tgCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGCcaacaa  <  1:1360629/61‑1 (MQ=255) tgCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGCcaacaa  <  1:1384395/61‑1 (MQ=255) tgCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGCcaacaa  <  1:1401132/61‑1 (MQ=255) tgCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGCcaacaa  <  1:1425703/61‑1 (MQ=255) tgCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGCcaacaa  <  1:1427797/61‑1 (MQ=255) tgCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGCcaacaa  <  1:1450766/61‑1 (MQ=255) tgCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGCcaacaa  <  1:179211/61‑1 (MQ=255)  gCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGCcaacaa  <  1:999205/60‑1 (MQ=255)                           cGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGCcaacaa  <  1:255887/35‑1 (MQ=255)                                                             | TGCTGAAGTTGATCTTCAATCTTAAGCGTATGCCAGAGCGCGATGCTCCGGCTGCCAACAA  >  W3110S.gb/4175664‑4175724

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑