Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4181597	4181634	38	61 [0]	[0] 31	gspE	general secretory pathway component, cryptic

TTCCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGGA  >  W3110S.gb/4181536‑4181596                                                             | ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:703665/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:303606/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:321734/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:362337/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:395748/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:440971/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:464792/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:471282/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:471752/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:511931/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:539163/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:542119/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:661060/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:676679/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:683022/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:68719/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:257516/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:715535/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:723964/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:729164/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:763769/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:788298/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:790016/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:803855/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:827913/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:888986/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:947757/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:950941/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:958861/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:961383/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:996396/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:234700/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:1021516/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:1037817/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:1038273/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:1058172/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:1065278/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:1081793/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:1095189/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:1096963/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:1118098/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:1163866/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:1195980/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:1195993/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:1197630/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:1249150/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:1261280/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:1291007/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:1309524/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:1343340/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:1343929/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:1363486/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:1366786/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:1434008/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:20027/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:217802/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:226563/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:232924/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:1016494/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACATTAATTCGGga  >  1:1084492/1‑61 (MQ=255) ttcCATCCTGTGGAATACGTTATTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGga  >  1:122065/1‑61 (MQ=255)                                                             | TTCCATCCTGTGGAATACGTTTTTCGGCGATATCAAGACGAGCCATGACCTTAATTCGGGA  >  W3110S.gb/4181536‑4181596

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑