Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4253811	4254417	607	65 [0]	[0] 43	[malM]	[malM]

GATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCTTT  >  W3110S.gb/4253749‑4253810                                                              | gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:685313/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:403331/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:1000795/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:455509/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:494295/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:49586/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:502224/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:525473/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:530727/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:549384/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:551190/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:575875/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:619073/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:625531/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:632654/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:669110/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:421031/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:685681/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:693839/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:7163/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:726117/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:737136/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:751004/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:752584/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:75891/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:780483/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:850471/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:876577/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:90858/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:975611/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:992489/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:1367615/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:10889/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:1098403/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:1185758/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:1188201/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:1196198/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:1217881/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:1224662/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:1290015/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:1291863/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:1292960/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:1295285/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:1327022/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:1328929/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:380642/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:1370649/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:138110/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:1395090/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:321063/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:30524/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:224609/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:1400597/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:1406596/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:1448163/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:1459630/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:185011/62‑1 (MQ=255) gATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:185040/62‑1 (MQ=255)  aTGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:1333320/61‑1 (MQ=255)   tGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:345985/60‑1 (MQ=255)   tGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:614047/60‑1 (MQ=255)       ttACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:620769/56‑1 (MQ=255)        tACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:98785/55‑1 (MQ=255)           tgaaactgaaaGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:612364/52‑1 (MQ=255)                         aaaaCGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCttt  <  1:1324520/38‑1 (MQ=255)                                                              | GATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCTTT  >  W3110S.gb/4253749‑4253810

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑