Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4316840	4316950	111	41 [0]	[2] 4	rpiR	DNA‑binding transcriptional repressor

TCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAA  >  W3110S.gb/4316779‑4316839                                                             | tCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCatattaa  >  1:601211/1‑61 (MQ=255) tCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCatattaa  >  1:264020/1‑61 (MQ=255) tCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCatattaa  >  1:287262/1‑61 (MQ=255) tCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCatattaa  >  1:295936/1‑61 (MQ=255) tCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCatattaa  >  1:304840/1‑61 (MQ=255) tCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCatattaa  >  1:338998/1‑61 (MQ=255) tCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCatattaa  >  1:421901/1‑61 (MQ=255) tCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCatattaa  >  1:455287/1‑61 (MQ=255) tCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCatattaa  >  1:486602/1‑61 (MQ=255) tCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCatattaa  >  1:574401/1‑61 (MQ=255) tCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCatattaa  >  1:232871/1‑61 (MQ=255) tCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCatattaa  >  1:62150/1‑61 (MQ=255) tCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCatattaa  >  1:681669/1‑61 (MQ=255) tCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCatattaa  >  1:731525/1‑61 (MQ=255) tCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCatattaa  >  1:761578/1‑61 (MQ=255) tCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCatattaa  >  1:844516/1‑61 (MQ=255) tCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCatattaa  >  1:895494/1‑61 (MQ=255) tCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCatattaa  >  1:913950/1‑61 (MQ=255) tCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCatattaa  >  1:914271/1‑61 (MQ=255) tCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCatattaa  >  1:915926/1‑61 (MQ=255) tCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCatattaa  >  1:1296274/1‑61 (MQ=255) tCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCatattaa  >  1:1016908/1‑61 (MQ=255) tCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCatattaa  >  1:1037057/1‑61 (MQ=255) tCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCatattaa  >  1:1057603/1‑61 (MQ=255) tCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCatattaa  >  1:1145042/1‑61 (MQ=255) tCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCatattaa  >  1:1146647/1‑61 (MQ=255) tCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCatattaa  >  1:1194115/1‑61 (MQ=255) tCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCatattaa  >  1:1227719/1‑61 (MQ=255) tCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCatattaa  >  1:1250567/1‑61 (MQ=255) tCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCatattaa  >  1:1288522/1‑61 (MQ=255) tCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCatattaa  >  1:1015707/1‑61 (MQ=255) tCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCatattaa  >  1:131790/1‑61 (MQ=255) tCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCatattaa  >  1:1335098/1‑61 (MQ=255) tCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCatattaa  >  1:1351319/1‑61 (MQ=255) tCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCatattaa  >  1:1356158/1‑61 (MQ=255) tCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCatattaa  >  1:1463975/1‑61 (MQ=255) tCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCatattaa  >  1:15028/1‑61 (MQ=255) tCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCatattaa  >  1:168087/1‑61 (MQ=255) tCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCatattaa  >  1:187044/1‑61 (MQ=255) tCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCatattaa  >  1:214347/1‑61 (MQ=255) tCTTATTTCAGCACGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCatattaa  >  1:695628/1‑61 (MQ=255)                                                             | TCTTATTTCAGCGCGCCTGGTGAGAAGAAATCAACAATTGCGCCGGTTTTTTGCATATTAA  >  W3110S.gb/4316779‑4316839

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑