Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4342188	4342354	167	56 [0]	[0] 49	adiY	DNA‑binding transcriptional activator

ATAATTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACATA  >  W3110S.gb/4342146‑4342187                                          | ataatTTGTTAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:1033257/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTGACTTACACAATTACGTAACata  >  1:854006/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTGCGTAACata  >  1:412615/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:689804/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:402524/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:452576/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:506144/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:560629/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:561575/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:570809/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:578944/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:62281/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:636986/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:644573/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:688066/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:383131/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:705277/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:721605/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:728240/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:731219/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:768008/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:810342/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:923164/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:928261/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:929689/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:973184/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:989556/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:991172/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:1351368/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:1095699/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:1098272/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:1112969/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:1127746/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:1162221/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:1180313/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:1211070/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:1258759/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:1278294/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:1291291/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:1301829/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:1333271/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:380397/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:1360903/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:1374425/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:1437338/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:1439073/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:1457893/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:1458265/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:147221/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:206539/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:25578/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:312942/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:355990/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:365167/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAACGCTGTCACTTAAACAATTACGTAACata  >  1:1461352/1‑42 (MQ=255) ataatTTGATAAAAGCTGTCACTTACACAATTACGTAACata  >  1:867719/1‑42 (MQ=255)                                          | ATAATTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACATA  >  W3110S.gb/4342146‑4342187

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑