Missing coverage evidence...
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TGACAGACATAAAGAACAACGATTCTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCA  >  W3110S.gb/4378796‑4378857                                                              | tGACAGACATAAAGAACTACGATTCTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCa  <  1:888972/62‑1 (MQ=255) tGACAGACATAAAGAACAACGATTCTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCa  <  1:686582/62‑1 (MQ=255) tGACAGACATAAAGAACAACGATTCTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCa  <  1:27234/62‑1 (MQ=255) tGACAGACATAAAGAACAACGATTCTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCa  <  1:277689/62‑1 (MQ=255) tGACAGACATAAAGAACAACGATTCTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCa  <  1:30172/62‑1 (MQ=255) tGACAGACATAAAGAACAACGATTCTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCa  <  1:326907/62‑1 (MQ=255) tGACAGACATAAAGAACAACGATTCTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCa  <  1:437632/62‑1 (MQ=255) tGACAGACATAAAGAACAACGATTCTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCa  <  1:519409/62‑1 (MQ=255) tGACAGACATAAAGAACAACGATTCTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCa  <  1:537554/62‑1 (MQ=255) tGACAGACATAAAGAACAACGATTCTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCa  <  1:55085/62‑1 (MQ=255) tGACAGACATAAAGAACAACGATTCTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCa  <  1:105627/62‑1 (MQ=255) tGACAGACATAAAGAACAACGATTCTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCa  <  1:708567/62‑1 (MQ=255) tGACAGACATAAAGAACAACGATTCTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCa  <  1:724154/62‑1 (MQ=255) tGACAGACATAAAGAACAACGATTCTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCa  <  1:821533/62‑1 (MQ=255) tGACAGACATAAAGAACAACGATTCTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCa  <  1:856603/62‑1 (MQ=255) tGACAGACATAAAGAACAACGATTCTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCa  <  1:860898/62‑1 (MQ=255) tGACAGACATAAAGAACAACGATTCTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCa  <  1:918069/62‑1 (MQ=255) tGACAGACATAAAGAACAACGATTCTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCa  <  1:971760/62‑1 (MQ=255) tGACAGACATAAAGAACAACGATTCTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCa  <  1:1243098/62‑1 (MQ=255) tGACAGACATAAAGAACAACGATTCTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCa  <  1:1019652/62‑1 (MQ=255) tGACAGACATAAAGAACAACGATTCTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCa  <  1:1056820/62‑1 (MQ=255) tGACAGACATAAAGAACAACGATTCTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCa  <  1:1090897/62‑1 (MQ=255) tGACAGACATAAAGAACAACGATTCTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCa  <  1:1113859/62‑1 (MQ=255) tGACAGACATAAAGAACAACGATTCTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCa  <  1:1136859/62‑1 (MQ=255) tGACAGACATAAAGAACAACGATTCTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCa  <  1:1202885/62‑1 (MQ=255) tGACAGACATAAAGAACAACGATTCTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCa  <  1:1226112/62‑1 (MQ=255) tGACAGACATAAAGAACAACGATTCTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCa  <  1:1235149/62‑1 (MQ=255) tGACAGACATAAAGAACAACGATTCTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCa  <  1:21618/62‑1 (MQ=255) tGACAGACATAAAGAACAACGATTCTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCa  <  1:1261633/62‑1 (MQ=255) tGACAGACATAAAGAACAACGATTCTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCa  <  1:1290625/62‑1 (MQ=255) tGACAGACATAAAGAACAACGATTCTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCa  <  1:1337560/62‑1 (MQ=255) tGACAGACATAAAGAACAACGATTCTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCa  <  1:134517/62‑1 (MQ=255) tGACAGACATAAAGAACAACGATTCTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCa  <  1:1386206/62‑1 (MQ=255) tGACAGACATAAAGAACAACGATTCTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCa  <  1:1407904/62‑1 (MQ=255) tGACAGACATAAAGAACAACGATTCTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCa  <  1:191757/62‑1 (MQ=255)          tAAAGAACAACGATTCTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCa  <  1:722643/53‑1 (MQ=255)                  aacGATTCTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCa  <  1:21881/45‑1 (MQ=255)                          tttATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCa  <  1:128712/37‑1 (MQ=255)                                                              | TGACAGACATAAAGAACAACGATTCTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCA  >  W3110S.gb/4378796‑4378857

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑