Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4401544	4401691	148	34 [0]	[0] 24	amiB	N‑acetylmuramoyl‑l‑alanine amidase II

TACTTTATCTCGGTGATGGGGCGCAGTGATGTGGCACGTAAGCAAAACGCCAATTTCCTCGT  >  W3110S.gb/4401482‑4401543                                                              | tACTTTATCTCGGTGATGGGGCGCAGTGATGTGTCACGTAAGCAAAACGCCAATTTCCTCgt  <  1:8597/62‑1 (MQ=255) tACTTTATCTCGGTGATGGGGCGCAGTGATGTGGCACGTAAGCAAAACGCCAATTTCCTCgt  <  1:412695/62‑1 (MQ=255) tACTTTATCTCGGTGATGGGGCGCAGTGATGTGGCACGTAAGCAAAACGCCAATTTCCTCgt  <  1:984271/62‑1 (MQ=255) tACTTTATCTCGGTGATGGGGCGCAGTGATGTGGCACGTAAGCAAAACGCCAATTTCCTCgt  <  1:969906/62‑1 (MQ=255) tACTTTATCTCGGTGATGGGGCGCAGTGATGTGGCACGTAAGCAAAACGCCAATTTCCTCgt  <  1:851846/62‑1 (MQ=255) tACTTTATCTCGGTGATGGGGCGCAGTGATGTGGCACGTAAGCAAAACGCCAATTTCCTCgt  <  1:817818/62‑1 (MQ=255) tACTTTATCTCGGTGATGGGGCGCAGTGATGTGGCACGTAAGCAAAACGCCAATTTCCTCgt  <  1:80848/62‑1 (MQ=255) tACTTTATCTCGGTGATGGGGCGCAGTGATGTGGCACGTAAGCAAAACGCCAATTTCCTCgt  <  1:79274/62‑1 (MQ=255) tACTTTATCTCGGTGATGGGGCGCAGTGATGTGGCACGTAAGCAAAACGCCAATTTCCTCgt  <  1:680207/62‑1 (MQ=255) tACTTTATCTCGGTGATGGGGCGCAGTGATGTGGCACGTAAGCAAAACGCCAATTTCCTCgt  <  1:668719/62‑1 (MQ=255) tACTTTATCTCGGTGATGGGGCGCAGTGATGTGGCACGTAAGCAAAACGCCAATTTCCTCgt  <  1:635613/62‑1 (MQ=255) tACTTTATCTCGGTGATGGGGCGCAGTGATGTGGCACGTAAGCAAAACGCCAATTTCCTCgt  <  1:497976/62‑1 (MQ=255) tACTTTATCTCGGTGATGGGGCGCAGTGATGTGGCACGTAAGCAAAACGCCAATTTCCTCgt  <  1:483890/62‑1 (MQ=255) tACTTTATCTCGGTGATGGGGCGCAGTGATGTGGCACGTAAGCAAAACGCCAATTTCCTCgt  <  1:429660/62‑1 (MQ=255) tACTTTATCTCGGTGATGGGGCGCAGTGATGTGGCACGTAAGCAAAACGCCAATTTCCTCgt  <  1:1007365/62‑1 (MQ=255) tACTTTATCTCGGTGATGGGGCGCAGTGATGTGGCACGTAAGCAAAACGCCAATTTCCTCgt  <  1:372326/62‑1 (MQ=255) tACTTTATCTCGGTGATGGGGCGCAGTGATGTGGCACGTAAGCAAAACGCCAATTTCCTCgt  <  1:1441208/62‑1 (MQ=255) tACTTTATCTCGGTGATGGGGCGCAGTGATGTGGCACGTAAGCAAAACGCCAATTTCCTCgt  <  1:1016510/62‑1 (MQ=255) tACTTTATCTCGGTGATGGGGCGCAGTGATGTGGCACGTAAGCAAAACGCCAATTTCCTCgt  <  1:1036026/62‑1 (MQ=255) tACTTTATCTCGGTGATGGGGCGCAGTGATGTGGCACGTAAGCAAAACGCCAATTTCCTCgt  <  1:110100/62‑1 (MQ=255) tACTTTATCTCGGTGATGGGGCGCAGTGATGTGGCACGTAAGCAAAACGCCAATTTCCTCgt  <  1:1107141/62‑1 (MQ=255) tACTTTATCTCGGTGATGGGGCGCAGTGATGTGGCACGTAAGCAAAACGCCAATTTCCTCgt  <  1:1174229/62‑1 (MQ=255) tACTTTATCTCGGTGATGGGGCGCAGTGATGTGGCACGTAAGCAAAACGCCAATTTCCTCgt  <  1:118240/62‑1 (MQ=255) tACTTTATCTCGGTGATGGGGCGCAGTGATGTGGCACGTAAGCAAAACGCCAATTTCCTCgt  <  1:1219543/62‑1 (MQ=255) tACTTTATCTCGGTGATGGGGCGCAGTGATGTGGCACGTAAGCAAAACGCCAATTTCCTCgt  <  1:1297055/62‑1 (MQ=255) tACTTTATCTCGGTGATGGGGCGCAGTGATGTGGCACGTAAGCAAAACGCCAATTTCCTCgt  <  1:1297729/62‑1 (MQ=255) tACTTTATCTCGGTGATGGGGCGCAGTGATGTGGCACGTAAGCAAAACGCCAATTTCCTCgt  <  1:1310722/62‑1 (MQ=255) tACTTTATCTCGGTGATGGGGCGCAGTGATGTGGCACGTAAGCAAAACGCCAATTTCCTCgt  <  1:1330966/62‑1 (MQ=255) tACTTTATCTCGGTGATGGGGCGCAGTGATGTGGCACGTAAGCAAAACGCCAATTTCCTCgt  <  1:1351246/62‑1 (MQ=255) tACTTTATCTCGGTGATGGGGCGCAGTGATGTGGCACGTAAGCAAAACGCCAATTTCCTCgt  <  1:340184/62‑1 (MQ=255)  aCTTTATCTCGGTGATGGGGCGCAGTGATGTGGCACGTAAGCAAAACGCCAATTTCCTCgt  <  1:1262954/61‑1 (MQ=255)  aCTTTATCTCGGTGATGGGGCGCAGTGATGTGGCACGTAAGCAAAACGCCAATTTCCTCgt  <  1:705206/61‑1 (MQ=255)   cTTTATCTCGGTGATGGGGCGCAGTGATGTGGCACGTAAGCAAAACGCCAATTTCCTCgt  <  1:602911/60‑1 (MQ=255)                 tGGGGCGCAGTGATGTGGCACGTAAGCAAAACGCCAATTTCCTCgt  <  1:492046/46‑1 (MQ=255)                                                              | TACTTTATCTCGGTGATGGGGCGCAGTGATGTGGCACGTAAGCAAAACGCCAATTTCCTCGT  >  W3110S.gb/4401482‑4401543

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑