Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4415659	4415789	131	30 [0]	[0] 10	yjfJ	predicted transcriptional regulator effector protein

ACAGCGCAGCGTATCGCTCAGTTTGAGCAGCAAATGGAAGTCG  >  W3110S.gb/4415616‑4415658                                           | acagcgCAGCGTATCGCTCAGTTTGAGCAGCAAATGGAAGTCg  <  1:280704/43‑1 (MQ=255) acagcgCAGCGTATCGCTCAGTTTGAGCAGCAAATGGAAGTCg  <  1:97529/43‑1 (MQ=255) acagcgCAGCGTATCGCTCAGTTTGAGCAGCAAATGGAAGTCg  <  1:931316/43‑1 (MQ=255) acagcgCAGCGTATCGCTCAGTTTGAGCAGCAAATGGAAGTCg  <  1:916812/43‑1 (MQ=255) acagcgCAGCGTATCGCTCAGTTTGAGCAGCAAATGGAAGTCg  <  1:706782/43‑1 (MQ=255) acagcgCAGCGTATCGCTCAGTTTGAGCAGCAAATGGAAGTCg  <  1:650957/43‑1 (MQ=255) acagcgCAGCGTATCGCTCAGTTTGAGCAGCAAATGGAAGTCg  <  1:552329/43‑1 (MQ=255) acagcgCAGCGTATCGCTCAGTTTGAGCAGCAAATGGAAGTCg  <  1:493678/43‑1 (MQ=255) acagcgCAGCGTATCGCTCAGTTTGAGCAGCAAATGGAAGTCg  <  1:454637/43‑1 (MQ=255) acagcgCAGCGTATCGCTCAGTTTGAGCAGCAAATGGAAGTCg  <  1:390708/43‑1 (MQ=255) acagcgCAGCGTATCGCTCAGTTTGAGCAGCAAATGGAAGTCg  <  1:382793/43‑1 (MQ=255) acagcgCAGCGTATCGCTCAGTTTGAGCAGCAAATGGAAGTCg  <  1:322572/43‑1 (MQ=255) acagcgCAGCGTATCGCTCAGTTTGAGCAGCAAATGGAAGTCg  <  1:315928/43‑1 (MQ=255) acagcgCAGCGTATCGCTCAGTTTGAGCAGCAAATGGAAGTCg  <  1:1089779/43‑1 (MQ=255) acagcgCAGCGTATCGCTCAGTTTGAGCAGCAAATGGAAGTCg  <  1:19990/43‑1 (MQ=255) acagcgCAGCGTATCGCTCAGTTTGAGCAGCAAATGGAAGTCg  <  1:1462500/43‑1 (MQ=255) acagcgCAGCGTATCGCTCAGTTTGAGCAGCAAATGGAAGTCg  <  1:1426356/43‑1 (MQ=255) acagcgCAGCGTATCGCTCAGTTTGAGCAGCAAATGGAAGTCg  <  1:1356143/43‑1 (MQ=255) acagcgCAGCGTATCGCTCAGTTTGAGCAGCAAATGGAAGTCg  <  1:1355153/43‑1 (MQ=255) acagcgCAGCGTATCGCTCAGTTTGAGCAGCAAATGGAAGTCg  <  1:1312061/43‑1 (MQ=255) acagcgCAGCGTATCGCTCAGTTTGAGCAGCAAATGGAAGTCg  <  1:1308338/43‑1 (MQ=255) acagcgCAGCGTATCGCTCAGTTTGAGCAGCAAATGGAAGTCg  <  1:1176840/43‑1 (MQ=255) acagcgCAGCGTATCGCTCAGTTTGAGCAGCAAATGGAAGTCg  <  1:1163456/43‑1 (MQ=255) acagcgCAGCGTATCGCTCAGTTTGAGCAGCAAATGGAAGTCg  <  1:1148398/43‑1 (MQ=255) acagcgCAGCGTATCGCTCAGTTTGAGCAGCAAATGGAAGTCg  <  1:1115491/43‑1 (MQ=255) acagcgCAGCGTATCGCTCAGTTTGAGCAGCAAATGGAAGTCg  <  1:1098804/43‑1 (MQ=255) acagcgCAGCGTATCGCTCAGTTTGAGCAGCAAATGGAAGTCg  <  1:1098625/43‑1 (MQ=255) acagcgCAGCGTATCGCTCAGTTTGAGCAGCAAATGGAAGGCg  <  1:1403589/43‑1 (MQ=255)  cagcgcagcgTATCGCTCAGTTTGAGCAGCAAATGGAAGTCg  <  1:81262/42‑1 (MQ=255)         gcgTATCGCTCAGTTTGAGCAGCAAATGGAAGTCg  <  1:460077/35‑1 (MQ=255)                                           | ACAGCGCAGCGTATCGCTCAGTTTGAGCAGCAAATGGAAGTCG  >  W3110S.gb/4415616‑4415658

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑