Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4461989	4461991	3	24 [0]	[0] 55	mpl/yjgA	UDP‑N‑acetylmuramate:L‑alanyl‑gamma‑D‑glutamyl‑ meso‑diaminopimelate ligase/conserved hypothetical protein

CTTGATGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTGCACCGTATCCGGCAAACCATACTCACATCAACA  >  W3110S.gb/4461927‑4461988                                                              | cTTGATGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTGCACCGTATCCGGCAAACCATACTCCCATcaaca  >  1:852357/1‑62 (MQ=255) cTTGATGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTGCACCGTATCCGGCAAACCATACTCACATcaaca  >  1:1190650/1‑62 (MQ=255) cTTGATGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTGCACCGTATCCGGCAAACCATACTCACATcaaca  >  1:956442/1‑62 (MQ=255) cTTGATGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTGCACCGTATCCGGCAAACCATACTCACATcaaca  >  1:939234/1‑62 (MQ=255) cTTGATGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTGCACCGTATCCGGCAAACCATACTCACATcaaca  >  1:850477/1‑62 (MQ=255) cTTGATGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTGCACCGTATCCGGCAAACCATACTCACATcaaca  >  1:847353/1‑62 (MQ=255) cTTGATGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTGCACCGTATCCGGCAAACCATACTCACATcaaca  >  1:824334/1‑62 (MQ=255) cTTGATGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTGCACCGTATCCGGCAAACCATACTCACATcaaca  >  1:637325/1‑62 (MQ=255) cTTGATGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTGCACCGTATCCGGCAAACCATACTCACATcaaca  >  1:621642/1‑62 (MQ=255) cTTGATGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTGCACCGTATCCGGCAAACCATACTCACATcaaca  >  1:4490/1‑62 (MQ=255) cTTGATGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTGCACCGTATCCGGCAAACCATACTCACATcaaca  >  1:314585/1‑62 (MQ=255) cTTGATGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTGCACCGTATCCGGCAAACCATACTCACATcaaca  >  1:190629/1‑62 (MQ=255) cTTGATGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTGCACCGTATCCGGCAAACCATACTCACATcaaca  >  1:1460555/1‑62 (MQ=255) cTTGATGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTGCACCGTATCCGGCAAACCATACTCACATcaaca  >  1:142559/1‑62 (MQ=255) cTTGATGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTGCACCGTATCCGGCAAACCATACTCACATcaaca  >  1:1377292/1‑62 (MQ=255) cTTGATGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTGCACCGTATCCGGCAAACCATACTCACATcaaca  >  1:1375595/1‑62 (MQ=255) cTTGATGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTGCACCGTATCCGGCAAACCATACTCACATcaaca  >  1:1358660/1‑62 (MQ=255) cTTGATGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTGCACCGTATCCGGCAAACCATACTCACATcaaca  >  1:1274392/1‑62 (MQ=255) cTTGATGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTGCACCGTATCCGGCAAACCATACTCACATcaaca  >  1:1273274/1‑62 (MQ=255) cTTGATGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTGCACCGTATCCGGCAAACCATACTCACATcaaca  >  1:1271765/1‑62 (MQ=255) cTTGATGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTGCACCGTATCCGGCAAACCATACTCACATcaaca  >  1:1204429/1‑62 (MQ=255) cTTGATGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTGCACCGTATCCGGCAAACCATACTCACATcaaca  >  1:102634/1‑62 (MQ=255) cTTGATGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTGCACCGTATCCGGCAAACCATAAACACATcaaca  >  1:713435/1‑62 (MQ=255) cTTGATGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTGCACCGTAGCCGGCAAACCATACTCACATcaaca  >  1:305240/1‑62 (MQ=255)                                                              | CTTGATGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTGCACCGTATCCGGCAAACCATACTCACATCAACA  >  W3110S.gb/4461927‑4461988

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑