Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4544945	4545107	163	53 [0]	[0] 21	yjhA/fimB	N‑acetylnuraminic acid outer membrane channel protein/tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA

TCATGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTG  >  W3110S.gb/4544887‑4544944                                                          | tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGTCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:503628/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:617750/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:175236/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:177337/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:25701/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:288115/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:292448/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:386273/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:46338/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:499765/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:586636/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:596488/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:600111/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:172418/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:679059/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:737624/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:740794/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:807497/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:869651/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:911482/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:913401/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:93180/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:932764/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:945055/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:948813/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:978719/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:1240164/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:1026152/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:1035232/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:1037433/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:105158/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:105499/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:1125397/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:1125652/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:1128420/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:1136224/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:1159935/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:1161246/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:1199092/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:1014390/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:1276764/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:128502/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:1316872/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:1336362/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:1369251/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:1371562/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:1377293/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:1383043/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:146055/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:1467992/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGCCGATCTg  >  1:1270281/1‑58 (MQ=255) tcatGAAATATCTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCAGAAGTCGATCTg  >  1:128576/1‑58 (MQ=255) taatGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTg  >  1:833093/3‑58 (MQ=255)                                                          | TCATGAAATATGTTTCCTGGTTTGTGGCTTGTAACTGGTCACTTCTGAAGTCGATCTG  >  W3110S.gb/4544887‑4544944

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑