Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	4547472	4547509	38	42 [0]	[0] 26	fimE/fimA	tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA/major type 1 subunit fimbrin

GCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTC  >  W3110S.gb/4547413‑4547471                                                           | gCATAAAAATATTATAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTc  <  1:374917/59‑1 (MQ=255) gCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTTTTTGATATGTAAATTATTTc  <  1:139161/59‑1 (MQ=255) gCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTc  <  1:625990/59‑1 (MQ=255) gCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTc  <  1:1009671/59‑1 (MQ=255) gCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTc  <  1:491067/59‑1 (MQ=255) gCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTc  <  1:496393/59‑1 (MQ=255) gCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTc  <  1:505745/59‑1 (MQ=255) gCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTc  <  1:517776/59‑1 (MQ=255) gCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTc  <  1:574639/59‑1 (MQ=255) gCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTc  <  1:609367/59‑1 (MQ=255) gCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTc  <  1:616091/59‑1 (MQ=255) gCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTc  <  1:616638/59‑1 (MQ=255) gCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTc  <  1:447721/59‑1 (MQ=255) gCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTc  <  1:69885/59‑1 (MQ=255) gCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTc  <  1:768273/59‑1 (MQ=255) gCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTc  <  1:820558/59‑1 (MQ=255) gCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTc  <  1:891999/59‑1 (MQ=255) gCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTc  <  1:929393/59‑1 (MQ=255) gCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTc  <  1:935361/59‑1 (MQ=255) gCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTc  <  1:975456/59‑1 (MQ=255) gCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTc  <  1:987460/59‑1 (MQ=255) gCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTc  <  1:403333/59‑1 (MQ=255) gCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTc  <  1:1023271/59‑1 (MQ=255) gCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTc  <  1:1081923/59‑1 (MQ=255) gCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTc  <  1:1120486/59‑1 (MQ=255) gCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTc  <  1:1167963/59‑1 (MQ=255) gCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTc  <  1:1199482/59‑1 (MQ=255) gCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTc  <  1:1376397/59‑1 (MQ=255) gCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTc  <  1:1430865/59‑1 (MQ=255) gCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTc  <  1:191813/59‑1 (MQ=255) gCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTc  <  1:197504/59‑1 (MQ=255) gCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTc  <  1:222132/59‑1 (MQ=255) gCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTc  <  1:229844/59‑1 (MQ=255) gCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTc  <  1:315920/59‑1 (MQ=255) gCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTc  <  1:345195/59‑1 (MQ=255) gCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTc  <  1:420579/59‑1 (MQ=255) gCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTCGATATGTAAATTATTTc  <  1:654535/59‑1 (MQ=255) gCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATATAACTGTTTGATATGTAAATTATTTc  <  1:1160426/59‑1 (MQ=255)  cATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTc  <  1:680658/58‑1 (MQ=255)  cATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTc  <  1:300838/58‑1 (MQ=255)  cATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTc  <  1:895001/58‑1 (MQ=255)                    cGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTc  <  1:1163459/40‑1 (MQ=255)                                                           | GCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTC  >  W3110S.gb/4547413‑4547471

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑