Missing coverage evidence...
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TGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTA  >  W3110S.gb/4557519‑4557580                                                              | tGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTa  <  1:1078413/62‑1 (MQ=255) tGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTa  <  1:898285/62‑1 (MQ=255) tGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTa  <  1:86135/62‑1 (MQ=255) tGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTa  <  1:836112/62‑1 (MQ=255) tGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTa  <  1:771769/62‑1 (MQ=255) tGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTa  <  1:714390/62‑1 (MQ=255) tGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTa  <  1:618063/62‑1 (MQ=255) tGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTa  <  1:55522/62‑1 (MQ=255) tGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTa  <  1:552117/62‑1 (MQ=255) tGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTa  <  1:491937/62‑1 (MQ=255) tGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTa  <  1:313854/62‑1 (MQ=255) tGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTa  <  1:304566/62‑1 (MQ=255) tGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTa  <  1:286633/62‑1 (MQ=255) tGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTa  <  1:266993/62‑1 (MQ=255) tGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTa  <  1:248739/62‑1 (MQ=255) tGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTa  <  1:229007/62‑1 (MQ=255) tGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTa  <  1:174417/62‑1 (MQ=255) tGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTa  <  1:173517/62‑1 (MQ=255) tGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTa  <  1:170362/62‑1 (MQ=255) tGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTa  <  1:1465712/62‑1 (MQ=255) tGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTa  <  1:1265586/62‑1 (MQ=255) tGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTa  <  1:122737/62‑1 (MQ=255) tGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTa  <  1:1224888/62‑1 (MQ=255) tGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTa  <  1:1196586/62‑1 (MQ=255) tGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTa  <  1:1160208/62‑1 (MQ=255) tGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTa  <  1:1141202/62‑1 (MQ=255) tGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTa  <  1:1001204/62‑1 (MQ=255) tGCGCGCCGTGCCGGTTACTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTAGAGTTTa  <  1:450336/62‑1 (MQ=255)  gcgcgcCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTa  <  1:1377344/61‑1 (MQ=255)         gTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTa  <  1:230338/54‑1 (MQ=255)                 tCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTa  <  1:1300811/46‑1 (MQ=255)                                                              | TGCGCGCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTA  >  W3110S.gb/4557519‑4557580

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑