Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	4565018	4565048	31	45 [0]	[0] 12	yjiH	conserved inner membrane protein

TGCAGGTTAGCGATCAGCGCCAGCGAGCAGATCCCTGGAATGCCCAACAACGGTTTTAGCAC  >  W3110S.gb/4564956‑4565017                                                              | tGCAGGTTAGCGATCAGCGCCAGCGAGCAGATCCCTGGAATGCCCAACAACGGTTTTAGcac  >  1:508838/1‑62 (MQ=255) tGCAGGTTAGCGATCAGCGCCAGCGAGCAGATCCCTGGAATGCCCAACAACGGTTTTAGcac  >  1:269731/1‑62 (MQ=255) tGCAGGTTAGCGATCAGCGCCAGCGAGCAGATCCCTGGAATGCCCAACAACGGTTTTAGcac  >  1:362980/1‑62 (MQ=255) tGCAGGTTAGCGATCAGCGCCAGCGAGCAGATCCCTGGAATGCCCAACAACGGTTTTAGcac  >  1:374202/1‑62 (MQ=255) tGCAGGTTAGCGATCAGCGCCAGCGAGCAGATCCCTGGAATGCCCAACAACGGTTTTAGcac  >  1:385541/1‑62 (MQ=255) tGCAGGTTAGCGATCAGCGCCAGCGAGCAGATCCCTGGAATGCCCAACAACGGTTTTAGcac  >  1:405336/1‑62 (MQ=255) tGCAGGTTAGCGATCAGCGCCAGCGAGCAGATCCCTGGAATGCCCAACAACGGTTTTAGcac  >  1:405842/1‑62 (MQ=255) tGCAGGTTAGCGATCAGCGCCAGCGAGCAGATCCCTGGAATGCCCAACAACGGTTTTAGcac  >  1:406341/1‑62 (MQ=255) tGCAGGTTAGCGATCAGCGCCAGCGAGCAGATCCCTGGAATGCCCAACAACGGTTTTAGcac  >  1:407430/1‑62 (MQ=255) tGCAGGTTAGCGATCAGCGCCAGCGAGCAGATCCCTGGAATGCCCAACAACGGTTTTAGcac  >  1:488865/1‑62 (MQ=255) tGCAGGTTAGCGATCAGCGCCAGCGAGCAGATCCCTGGAATGCCCAACAACGGTTTTAGcac  >  1:502916/1‑62 (MQ=255) tGCAGGTTAGCGATCAGCGCCAGCGAGCAGATCCCTGGAATGCCCAACAACGGTTTTAGcac  >  1:220939/1‑62 (MQ=255) tGCAGGTTAGCGATCAGCGCCAGCGAGCAGATCCCTGGAATGCCCAACAACGGTTTTAGcac  >  1:605876/1‑62 (MQ=255) tGCAGGTTAGCGATCAGCGCCAGCGAGCAGATCCCTGGAATGCCCAACAACGGTTTTAGcac  >  1:614958/1‑62 (MQ=255) tGCAGGTTAGCGATCAGCGCCAGCGAGCAGATCCCTGGAATGCCCAACAACGGTTTTAGcac  >  1:630198/1‑62 (MQ=255) tGCAGGTTAGCGATCAGCGCCAGCGAGCAGATCCCTGGAATGCCCAACAACGGTTTTAGcac  >  1:653479/1‑62 (MQ=255) tGCAGGTTAGCGATCAGCGCCAGCGAGCAGATCCCTGGAATGCCCAACAACGGTTTTAGcac  >  1:680135/1‑62 (MQ=255) tGCAGGTTAGCGATCAGCGCCAGCGAGCAGATCCCTGGAATGCCCAACAACGGTTTTAGcac  >  1:70328/1‑62 (MQ=255) tGCAGGTTAGCGATCAGCGCCAGCGAGCAGATCCCTGGAATGCCCAACAACGGTTTTAGcac  >  1:748410/1‑62 (MQ=255) tGCAGGTTAGCGATCAGCGCCAGCGAGCAGATCCCTGGAATGCCCAACAACGGTTTTAGcac  >  1:794510/1‑62 (MQ=255) tGCAGGTTAGCGATCAGCGCCAGCGAGCAGATCCCTGGAATGCCCAACAACGGTTTTAGcac  >  1:930289/1‑62 (MQ=255) tGCAGGTTAGCGATCAGCGCCAGCGAGCAGATCCCTGGAATGCCCAACAACGGTTTTAGcac  >  1:1332473/1‑62 (MQ=255) tGCAGGTTAGCGATCAGCGCCAGCGAGCAGATCCCTGGAATGCCCAACAACGGTTTTAGcac  >  1:102215/1‑62 (MQ=255) tGCAGGTTAGCGATCAGCGCCAGCGAGCAGATCCCTGGAATGCCCAACAACGGTTTTAGcac  >  1:1073046/1‑62 (MQ=255) tGCAGGTTAGCGATCAGCGCCAGCGAGCAGATCCCTGGAATGCCCAACAACGGTTTTAGcac  >  1:1130770/1‑62 (MQ=255) tGCAGGTTAGCGATCAGCGCCAGCGAGCAGATCCCTGGAATGCCCAACAACGGTTTTAGcac  >  1:1143146/1‑62 (MQ=255) tGCAGGTTAGCGATCAGCGCCAGCGAGCAGATCCCTGGAATGCCCAACAACGGTTTTAGcac  >  1:1145492/1‑62 (MQ=255) tGCAGGTTAGCGATCAGCGCCAGCGAGCAGATCCCTGGAATGCCCAACAACGGTTTTAGcac  >  1:1233150/1‑62 (MQ=255) tGCAGGTTAGCGATCAGCGCCAGCGAGCAGATCCCTGGAATGCCCAACAACGGTTTTAGcac  >  1:1247490/1‑62 (MQ=255) tGCAGGTTAGCGATCAGCGCCAGCGAGCAGATCCCTGGAATGCCCAACAACGGTTTTAGcac  >  1:1269386/1‑62 (MQ=255) tGCAGGTTAGCGATCAGCGCCAGCGAGCAGATCCCTGGAATGCCCAACAACGGTTTTAGcac  >  1:1278266/1‑62 (MQ=255) tGCAGGTTAGCGATCAGCGCCAGCGAGCAGATCCCTGGAATGCCCAACAACGGTTTTAGcac  >  1:1297512/1‑62 (MQ=255) tGCAGGTTAGCGATCAGCGCCAGCGAGCAGATCCCTGGAATGCCCAACAACGGTTTTAGcac  >  1:1344364/1‑62 (MQ=255) tGCAGGTTAGCGATCAGCGCCAGCGAGCAGATCCCTGGAATGCCCAACAACGGTTTTAGcac  >  1:1346815/1‑62 (MQ=255) tGCAGGTTAGCGATCAGCGCCAGCGAGCAGATCCCTGGAATGCCCAACAACGGTTTTAGcac  >  1:1348440/1‑62 (MQ=255) tGCAGGTTAGCGATCAGCGCCAGCGAGCAGATCCCTGGAATGCCCAACAACGGTTTTAGcac  >  1:1382445/1‑62 (MQ=255) tGCAGGTTAGCGATCAGCGCCAGCGAGCAGATCCCTGGAATGCCCAACAACGGTTTTAGcac  >  1:973557/1‑62 (MQ=255) tGCAGGTTAGCGATCAGCGCCAGCGAGCAGATCCCTGGAATGCCCAACAACGGTTTTAGcac  >  1:1399796/1‑62 (MQ=255) tGCAGGTTAGCGATCAGCGCCAGCGAGCAGATCCCTGGAATGCCCAACAACGGTTTTAGcac  >  1:1404257/1‑62 (MQ=255) tGCAGGTTAGCGATCAGCGCCAGCGAGCAGATCCCTGGAATGCCCAACAACGGTTTTAGcac  >  1:968437/1‑62 (MQ=255) tGCAGGTTAGCGATCAGCGCCAGCGAGCAGATCCCTGGAATGCCCAACAACGGTTTTAGcac  >  1:1446092/1‑62 (MQ=255) tGCAGGTTAGCGATCAGCGCCAGCGAGCAGATACCTGGAATGCCCAACAACGGTTTTAGcac  >  1:989108/1‑62 (MQ=255) tGCAGGTTAGCGATCAGCGCCAGCCAGCAGATCCCTGGAATGCCCAACAACGGTTTTAGcac  >  1:1392197/1‑62 (MQ=255) tGCAGGTTAGCGATCAGCGCCAGAGAGCAGATCCCTGGAATGCCCAACAACGGTTTTAGcac  >  1:1064084/1‑62 (MQ=255) tGCAGGTTAGCGATAAGCGCCAGCGAGCAGATCCCTGGAATGCCCAACAACGGTTTTAGcac  >  1:1419973/1‑62 (MQ=255)                                                              | TGCAGGTTAGCGATCAGCGCCAGCGAGCAGATCCCTGGAATGCCCAACAACGGTTTTAGCAC  >  W3110S.gb/4564956‑4565017

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑