Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4565441	4565561	121	29 [0]	[0] 6	yjiH/kptA	conserved inner membrane protein/2'‑phosphotransferase

TTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGCC  >  W3110S.gb/4565379‑4565440                                                              | tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:1060047/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:968413/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:954997/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:941531/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:863667/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:817860/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:705246/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:667489/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:661553/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:598450/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:510858/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:508716/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:487485/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:391408/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:303242/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:298584/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:293261/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:200128/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:169694/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:1344222/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:1304199/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:1255517/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:120103/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:1191890/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:109552/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:1006850/62‑1 (MQ=255) tttttGTGTTTGTGTGTTGCTCGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:693742/62‑1 (MQ=255)  ttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:395695/61‑1 (MQ=255)  ttttGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGcc  <  1:62873/61‑1 (MQ=255)                                                              | TTTTTGTGTTTGTGTGTTGCTTGAGCCAGGAAAATTCCTGGAACTGAAAAACCTTATCAGCC  >  W3110S.gb/4565379‑4565440

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑