Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	4568111	4568128	18	44 [0]	[0] 9	yjiK	conserved hypothetical protein

AGGTTTGTTGATAGTGCTAAAAAGAGTATTGCTTTGTGCCGACCAGGTCAGCGAAGAGATAT  >  W3110S.gb/4568049‑4568110                                                              | aGGTTTGTTGATAGTGCTAAAAAGAGTATTGCTTTGTGCCGACCAGGTCAGCGAAGAGatat  <  1:41981/62‑1 (MQ=255) aGGTTTGTTGATAGTGCTAAAAAGAGTATTGCTTTGTGCCGACCAGGTCAGCGAAGAGatat  <  1:1064139/62‑1 (MQ=255) aGGTTTGTTGATAGTGCTAAAAAGAGTATTGCTTTGTGCCGACCAGGTCAGCGAAGAGatat  <  1:206753/62‑1 (MQ=255) aGGTTTGTTGATAGTGCTAAAAAGAGTATTGCTTTGTGCCGACCAGGTCAGCGAAGAGatat  <  1:241351/62‑1 (MQ=255) aGGTTTGTTGATAGTGCTAAAAAGAGTATTGCTTTGTGCCGACCAGGTCAGCGAAGAGatat  <  1:258345/62‑1 (MQ=255) aGGTTTGTTGATAGTGCTAAAAAGAGTATTGCTTTGTGCCGACCAGGTCAGCGAAGAGatat  <  1:270884/62‑1 (MQ=255) aGGTTTGTTGATAGTGCTAAAAAGAGTATTGCTTTGTGCCGACCAGGTCAGCGAAGAGatat  <  1:320860/62‑1 (MQ=255) aGGTTTGTTGATAGTGCTAAAAAGAGTATTGCTTTGTGCCGACCAGGTCAGCGAAGAGatat  <  1:340639/62‑1 (MQ=255) aGGTTTGTTGATAGTGCTAAAAAGAGTATTGCTTTGTGCCGACCAGGTCAGCGAAGAGatat  <  1:347455/62‑1 (MQ=255) aGGTTTGTTGATAGTGCTAAAAAGAGTATTGCTTTGTGCCGACCAGGTCAGCGAAGAGatat  <  1:379954/62‑1 (MQ=255) aGGTTTGTTGATAGTGCTAAAAAGAGTATTGCTTTGTGCCGACCAGGTCAGCGAAGAGatat  <  1:387529/62‑1 (MQ=255) aGGTTTGTTGATAGTGCTAAAAAGAGTATTGCTTTGTGCCGACCAGGTCAGCGAAGAGatat  <  1:198257/62‑1 (MQ=255) aGGTTTGTTGATAGTGCTAAAAAGAGTATTGCTTTGTGCCGACCAGGTCAGCGAAGAGatat  <  1:449093/62‑1 (MQ=255) aGGTTTGTTGATAGTGCTAAAAAGAGTATTGCTTTGTGCCGACCAGGTCAGCGAAGAGatat  <  1:477572/62‑1 (MQ=255) aGGTTTGTTGATAGTGCTAAAAAGAGTATTGCTTTGTGCCGACCAGGTCAGCGAAGAGatat  <  1:489143/62‑1 (MQ=255) aGGTTTGTTGATAGTGCTAAAAAGAGTATTGCTTTGTGCCGACCAGGTCAGCGAAGAGatat  <  1:58389/62‑1 (MQ=255) aGGTTTGTTGATAGTGCTAAAAAGAGTATTGCTTTGTGCCGACCAGGTCAGCGAAGAGatat  <  1:693493/62‑1 (MQ=255) aGGTTTGTTGATAGTGCTAAAAAGAGTATTGCTTTGTGCCGACCAGGTCAGCGAAGAGatat  <  1:696984/62‑1 (MQ=255) aGGTTTGTTGATAGTGCTAAAAAGAGTATTGCTTTGTGCCGACCAGGTCAGCGAAGAGatat  <  1:758668/62‑1 (MQ=255) aGGTTTGTTGATAGTGCTAAAAAGAGTATTGCTTTGTGCCGACCAGGTCAGCGAAGAGatat  <  1:796207/62‑1 (MQ=255) aGGTTTGTTGATAGTGCTAAAAAGAGTATTGCTTTGTGCCGACCAGGTCAGCGAAGAGatat  <  1:875101/62‑1 (MQ=255) aGGTTTGTTGATAGTGCTAAAAAGAGTATTGCTTTGTGCCGACCAGGTCAGCGAAGAGatat  <  1:952269/62‑1 (MQ=255) aGGTTTGTTGATAGTGCTAAAAAGAGTATTGCTTTGTGCCGACCAGGTCAGCGAAGAGatat  <  1:1164841/62‑1 (MQ=255) aGGTTTGTTGATAGTGCTAAAAAGAGTATTGCTTTGTGCCGACCAGGTCAGCGAAGAGatat  <  1:1078246/62‑1 (MQ=255) aGGTTTGTTGATAGTGCTAAAAAGAGTATTGCTTTGTGCCGACCAGGTCAGCGAAGAGatat  <  1:1080451/62‑1 (MQ=255) aGGTTTGTTGATAGTGCTAAAAAGAGTATTGCTTTGTGCCGACCAGGTCAGCGAAGAGatat  <  1:1115652/62‑1 (MQ=255) aGGTTTGTTGATAGTGCTAAAAAGAGTATTGCTTTGTGCCGACCAGGTCAGCGAAGAGatat  <  1:1126111/62‑1 (MQ=255) aGGTTTGTTGATAGTGCTAAAAAGAGTATTGCTTTGTGCCGACCAGGTCAGCGAAGAGatat  <  1:1126483/62‑1 (MQ=255) aGGTTTGTTGATAGTGCTAAAAAGAGTATTGCTTTGTGCCGACCAGGTCAGCGAAGAGatat  <  1:1137553/62‑1 (MQ=255) aGGTTTGTTGATAGTGCTAAAAAGAGTATTGCTTTGTGCCGACCAGGTCAGCGAAGAGatat  <  1:1142086/62‑1 (MQ=255) aGGTTTGTTGATAGTGCTAAAAAGAGTATTGCTTTGTGCCGACCAGGTCAGCGAAGAGatat  <  1:1143775/62‑1 (MQ=255) aGGTTTGTTGATAGTGCTAAAAAGAGTATTGCTTTGTGCCGACCAGGTCAGCGAAGAGatat  <  1:1164141/62‑1 (MQ=255) aGGTTTGTTGATAGTGCTAAAAAGAGTATTGCTTTGTGCCGACCAGGTCAGCGAAGAGatat  <  1:165960/62‑1 (MQ=255) aGGTTTGTTGATAGTGCTAAAAAGAGTATTGCTTTGTGCCGACCAGGTCAGCGAAGAGatat  <  1:1178053/62‑1 (MQ=255) aGGTTTGTTGATAGTGCTAAAAAGAGTATTGCTTTGTGCCGACCAGGTCAGCGAAGAGatat  <  1:1211696/62‑1 (MQ=255) aGGTTTGTTGATAGTGCTAAAAAGAGTATTGCTTTGTGCCGACCAGGTCAGCGAAGAGatat  <  1:1291201/62‑1 (MQ=255) aGGTTTGTTGATAGTGCTAAAAAGAGTATTGCTTTGTGCCGACCAGGTCAGCGAAGAGatat  <  1:1353798/62‑1 (MQ=255) aGGTTTGTTGATAGTGCTAAAAAGAGTATTGCTTTGTGCCGACCAGGTCAGCGAAGAGatat  <  1:1365197/62‑1 (MQ=255) aGGTTTGTTGATAGTGCTAAAAAGAGTATTGCTTTGTGCCGACCAGGTCAGCGAAGAGatat  <  1:138287/62‑1 (MQ=255) aGGTTTGTTGATAGTGCTAAAAAGAGTATTGCTTTGTGCCGACCAGGTCAGCGAAGAGatat  <  1:1397547/62‑1 (MQ=255) aGGTTTGTTGATAGTGCTAAAAAGAGTATTGCTTTGTGCCGACCAGGTCAGCGAAGAGatat  <  1:1401294/62‑1 (MQ=255) aGGTTTGTTGATAGTGCTAAAAAGAGTATTGCTTTGTGCCGACCAGGTCAGCGAAGAGatat  <  1:1406377/62‑1 (MQ=255) aGGTTTGTTGATAGTGCTAAAAAGAGTATTGCTTTGTGCCGACCAGGTCAGCGAAGAGatat  <  1:1423231/62‑1 (MQ=255)                     aaaGAGTATTGCTTTGTGCCGACCAGGTCAGCGAAGAGatat  <  1:792637/42‑1 (MQ=255)                                                              | AGGTTTGTTGATAGTGCTAAAAAGAGTATTGCTTTGTGCCGACCAGGTCAGCGAAGAGATAT  >  W3110S.gb/4568049‑4568110

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑