Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4577326	4577391	66	61 [0]	[0] 23	yjiT	conserved hypothetical protein

TATGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTA  >  W3110S.gb/4577274‑4577325                                                    | tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:516890/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:27759/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:103580/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:307775/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:312415/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:369478/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:381039/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:400795/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:428477/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:435695/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:447779/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:451133/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:463384/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:482812/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:297839/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:522066/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:591576/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:609434/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:612143/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:631363/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:644617/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:748715/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:749493/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:801325/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:91300/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:940491/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:941553/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:997130/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:233741/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:106208/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:1065437/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:1086673/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:1104238/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:1143538/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:1158122/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:1168991/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:1179493/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:1184836/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:1190071/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:1272702/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:1293295/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:1352364/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:1400719/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:253968/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:208364/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:183559/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:17076/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:16692/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:156710/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:1453209/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:1452541/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:1447685/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:1428226/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:1373898/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTATGAGTGGTa  <  1:320675/52‑1 (MQ=255) tatGTAATAGGGACTTTGCCGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:97365/52‑1 (MQ=255)  atGTAATAGGGACTTTTCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:1165143/51‑1 (MQ=255)  atGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:763565/51‑1 (MQ=255)  atGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:839796/51‑1 (MQ=255)             aCTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:401409/40‑1 (MQ=255)             aCTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTa  <  1:1054927/40‑1 (MQ=255)                                                    | TATGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTA  >  W3110S.gb/4577274‑4577325

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑