Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	78486	78491	6	75 [0]	[0] 6	setA	broad specificity sugar efflux system

ATGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTGG  >  W3110S.gb/78441‑78485                                             | aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGTTGGTCATAGCAGTgg  <  1:876592/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTGATAGCAGTgg  <  1:1007920/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:510269/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:651497/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:630468/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:62225/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:58923/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:587061/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:584168/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:564253/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:511065/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:981402/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:378769/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:492746/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:460703/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:44854/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:42882/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:426301/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:42342/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:798123/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:1002247/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:973583/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:972476/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:968605/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:945255/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:900399/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:877767/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:864142/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:68723/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:791029/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:772872/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:768880/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:742049/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:724610/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:723999/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:712010/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:1251749/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:357192/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:1362943/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:1325123/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:1310978/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:1302834/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:1285570/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:1278915/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:1274913/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:1374952/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:1234632/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:1233358/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:1216110/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:1180211/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:1171830/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:1107562/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:1097018/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:1068437/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:1398326/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:325927/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:293935/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:288046/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:28592/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:27264/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:24671/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:205706/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:191802/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:169752/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:166852/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:146114/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:1441719/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:1438742/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:1398920/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:1388403/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGGCATAGCAGTgg  <  1:73627/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGATCATAGCAGTgg  <  1:427490/45‑1 (MQ=255) aTGTCAAACGTTATGGTAAGAGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:797809/45‑1 (MQ=255)  tGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:463835/44‑1 (MQ=255)  tGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTgg  <  1:1209959/44‑1 (MQ=255)                                             | ATGTCAAACGTTATGGTAAGCGGCGAATGATGGTCATAGCAGTGG  >  W3110S.gb/78441‑78485

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑