Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	96681	96960	280	28 [0]	[0] 17	mraY	phospho‑N‑acetylmuramoyl‑pentapeptide transferase

ATTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTGGGCGACCGGCAATATGAACTTTGCCAGCT  >  W3110S.gb/96619‑96680                                                              | aTTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTGGGCGACCGGCAATATGAACTTTGCCAGCt  <  1:345927/62‑1 (MQ=255) aTTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTGGGCGACCGGCAATATGAACTTTGCCAGCt  <  1:996387/62‑1 (MQ=255) aTTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTGGGCGACCGGCAATATGAACTTTGCCAGCt  <  1:949662/62‑1 (MQ=255) aTTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTGGGCGACCGGCAATATGAACTTTGCCAGCt  <  1:947349/62‑1 (MQ=255) aTTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTGGGCGACCGGCAATATGAACTTTGCCAGCt  <  1:823044/62‑1 (MQ=255) aTTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTGGGCGACCGGCAATATGAACTTTGCCAGCt  <  1:795890/62‑1 (MQ=255) aTTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTGGGCGACCGGCAATATGAACTTTGCCAGCt  <  1:772227/62‑1 (MQ=255) aTTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTGGGCGACCGGCAATATGAACTTTGCCAGCt  <  1:694398/62‑1 (MQ=255) aTTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTGGGCGACCGGCAATATGAACTTTGCCAGCt  <  1:639556/62‑1 (MQ=255) aTTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTGGGCGACCGGCAATATGAACTTTGCCAGCt  <  1:587503/62‑1 (MQ=255) aTTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTGGGCGACCGGCAATATGAACTTTGCCAGCt  <  1:558982/62‑1 (MQ=255) aTTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTGGGCGACCGGCAATATGAACTTTGCCAGCt  <  1:532963/62‑1 (MQ=255) aTTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTGGGCGACCGGCAATATGAACTTTGCCAGCt  <  1:413502/62‑1 (MQ=255) aTTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTGGGCGACCGGCAATATGAACTTTGCCAGCt  <  1:1015772/62‑1 (MQ=255) aTTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTGGGCGACCGGCAATATGAACTTTGCCAGCt  <  1:317946/62‑1 (MQ=255) aTTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTGGGCGACCGGCAATATGAACTTTGCCAGCt  <  1:274411/62‑1 (MQ=255) aTTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTGGGCGACCGGCAATATGAACTTTGCCAGCt  <  1:264785/62‑1 (MQ=255) aTTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTGGGCGACCGGCAATATGAACTTTGCCAGCt  <  1:233635/62‑1 (MQ=255) aTTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTGGGCGACCGGCAATATGAACTTTGCCAGCt  <  1:147298/62‑1 (MQ=255) aTTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTGGGCGACCGGCAATATGAACTTTGCCAGCt  <  1:1463423/62‑1 (MQ=255) aTTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTGGGCGACCGGCAATATGAACTTTGCCAGCt  <  1:129877/62‑1 (MQ=255) aTTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTGGGCGACCGGCAATATGAACTTTGCCAGCt  <  1:1182348/62‑1 (MQ=255) aTTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTGGGCGACCGGCAATATGAACTTTGCCAGCt  <  1:1105815/62‑1 (MQ=255) aTTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTGGGCGACCGGCAATATGAACTTTGCCAGCt  <  1:1104582/62‑1 (MQ=255) aTTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTGGGCGACCGGCAATATGAACTTTGCCAGCt  <  1:1018715/62‑1 (MQ=255)  tttGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTGGGCGACCGGCAATATGAACTTTGCCAGCt  <  1:732781/61‑1 (MQ=255)       cGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGGGGGCGACCGGCAATATGAACTTTGCCAGCt  <  1:107228/56‑1 (MQ=255)                     cgcTGGTGGCGTGGGCGACCGGCAATATGAACTTTGCCAGCt  <  1:265359/42‑1 (MQ=255)                                                              | ATTTGTCGCCGGTGGTTTTGCGCTGGTGGCGTGGGCGACCGGCAATATGAACTTTGCCAGCT  >  W3110S.gb/96619‑96680

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑