Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	107677	108314	638	38 [0]	[3] 4	secM–[secA]	secM,[secA]

AACTTATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATAC  >  W3110S.gb/107615‑107676                                                              | aaCTTATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATAc  <  1:643711/62‑1 (MQ=255) aaCTTATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATAc  <  1:299682/62‑1 (MQ=255) aaCTTATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATAc  <  1:353446/62‑1 (MQ=255) aaCTTATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATAc  <  1:494853/62‑1 (MQ=255) aaCTTATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATAc  <  1:497561/62‑1 (MQ=255) aaCTTATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATAc  <  1:501984/62‑1 (MQ=255) aaCTTATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATAc  <  1:592351/62‑1 (MQ=255) aaCTTATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATAc  <  1:615870/62‑1 (MQ=255) aaCTTATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATAc  <  1:642057/62‑1 (MQ=255) aaCTTATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATAc  <  1:322712/62‑1 (MQ=255) aaCTTATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATAc  <  1:733404/62‑1 (MQ=255) aaCTTATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATAc  <  1:758560/62‑1 (MQ=255) aaCTTATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATAc  <  1:859759/62‑1 (MQ=255) aaCTTATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATAc  <  1:884295/62‑1 (MQ=255) aaCTTATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATAc  <  1:913822/62‑1 (MQ=255) aaCTTATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATAc  <  1:92980/62‑1 (MQ=255) aaCTTATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATAc  <  1:95077/62‑1 (MQ=255) aaCTTATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATAc  <  1:9709/62‑1 (MQ=255) aaCTTATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATAc  <  1:1352908/62‑1 (MQ=255) aaCTTATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATAc  <  1:1065831/62‑1 (MQ=255) aaCTTATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATAc  <  1:1091807/62‑1 (MQ=255) aaCTTATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATAc  <  1:1095518/62‑1 (MQ=255) aaCTTATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATAc  <  1:1147324/62‑1 (MQ=255) aaCTTATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATAc  <  1:1155968/62‑1 (MQ=255) aaCTTATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATAc  <  1:116574/62‑1 (MQ=255) aaCTTATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATAc  <  1:1193787/62‑1 (MQ=255) aaCTTATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATAc  <  1:1207834/62‑1 (MQ=255) aaCTTATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATAc  <  1:284060/62‑1 (MQ=255) aaCTTATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATAc  <  1:1392/62‑1 (MQ=255) aaCTTATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATAc  <  1:1430668/62‑1 (MQ=255) aaCTTATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATAc  <  1:1467139/62‑1 (MQ=255) aaCTTATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATAc  <  1:1469102/62‑1 (MQ=255) aaCTTATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATAc  <  1:169799/62‑1 (MQ=255) aaCTTATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATAc  <  1:256980/62‑1 (MQ=255) aaCTTATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGA‑AAGATTTGTGCGCTAAATAc  <  1:943262/61‑1 (MQ=255)                 tGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATAc  <  1:453832/46‑1 (MQ=255)                       ggACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATAc  <  1:211333/40‑1 (MQ=255)                         aCTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATAc  <  1:1021221/38‑1 (MQ=255)                                                              | AACTTATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATAC  >  W3110S.gb/107615‑107676

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑