Missing coverage evidence...
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CAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGAT  >  W3110S.gb/246259‑246319                                                             | cAAATAAATCATCGGCGTCTTTGTCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTttgat  <  1:762058/61‑1 (MQ=255) cAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTttgat  <  1:98416/61‑1 (MQ=255) cAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTttgat  <  1:788737/61‑1 (MQ=255) cAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTttgat  <  1:856234/61‑1 (MQ=255) cAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTttgat  <  1:673241/61‑1 (MQ=255) cAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTttgat  <  1:575418/61‑1 (MQ=255) cAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTttgat  <  1:570867/61‑1 (MQ=255) cAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTttgat  <  1:394483/61‑1 (MQ=255) cAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTttgat  <  1:897257/61‑1 (MQ=255) cAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTttgat  <  1:915457/61‑1 (MQ=255) cAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTttgat  <  1:1403599/61‑1 (MQ=255) cAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTttgat  <  1:1364123/61‑1 (MQ=255) cAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTttgat  <  1:1350836/61‑1 (MQ=255) cAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTttgat  <  1:1344240/61‑1 (MQ=255) cAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTttgat  <  1:1227482/61‑1 (MQ=255) cAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTttgat  <  1:1219953/61‑1 (MQ=255) cAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTttgat  <  1:945673/61‑1 (MQ=255) cAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTttgat  <  1:1184924/61‑1 (MQ=255) cAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTttgat  <  1:1112622/61‑1 (MQ=255) cAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTttgat  <  1:1097599/61‑1 (MQ=255)  aaataaatCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTttgat  <  1:923162/60‑1 (MQ=255)  aaataaatCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTttgat  <  1:893782/60‑1 (MQ=255)  aaataaatCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTttgat  <  1:978169/60‑1 (MQ=255)  aaataaatCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTttgat  <  1:502236/60‑1 (MQ=255)  aaataaatCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTttgat  <  1:851359/60‑1 (MQ=255)  aaataaatCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTttgat  <  1:812259/60‑1 (MQ=255)  aaataaatCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTttgat  <  1:1049552/60‑1 (MQ=255)  aaataaatCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTttgat  <  1:2188/60‑1 (MQ=255)  aaataaatCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTttgat  <  1:212504/60‑1 (MQ=255)  aaataaatCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTttgat  <  1:1267587/60‑1 (MQ=255)  aaataaatCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTttgat  <  1:1191549/60‑1 (MQ=255)  aaataaatCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTttgat  <  1:1149519/60‑1 (MQ=255)  aaataaatCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTttgat  <  1:1055875/60‑1 (MQ=255)   aataaatCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTttgat  <  1:921577/59‑1 (MQ=255)        atcatcGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTttgat  <  1:786999/54‑1 (MQ=255)                                                             | CAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGAT  >  W3110S.gb/246259‑246319

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑