Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	258962	259112	151	33 [0]	[0] 13	phoE	outer membrane phosphoporin protein E

TTGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCAC  >  W3110S.gb/258900‑258961                                                              | ttGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCAc  <  1:553131/62‑1 (MQ=255) ttGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCAc  <  1:392754/62‑1 (MQ=255) ttGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCAc  <  1:422252/62‑1 (MQ=255) ttGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCAc  <  1:426161/62‑1 (MQ=255) ttGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCAc  <  1:457698/62‑1 (MQ=255) ttGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCAc  <  1:473849/62‑1 (MQ=255) ttGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCAc  <  1:522629/62‑1 (MQ=255) ttGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCAc  <  1:53714/62‑1 (MQ=255) ttGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCAc  <  1:551357/62‑1 (MQ=255) ttGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCAc  <  1:360055/62‑1 (MQ=255) ttGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCAc  <  1:586652/62‑1 (MQ=255) ttGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCAc  <  1:669033/62‑1 (MQ=255) ttGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCAc  <  1:688839/62‑1 (MQ=255) ttGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCAc  <  1:699092/62‑1 (MQ=255) ttGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCAc  <  1:739258/62‑1 (MQ=255) ttGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCAc  <  1:815073/62‑1 (MQ=255) ttGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCAc  <  1:982627/62‑1 (MQ=255) ttGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCAc  <  1:1079270/62‑1 (MQ=255) ttGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCAc  <  1:298460/62‑1 (MQ=255) ttGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCAc  <  1:259422/62‑1 (MQ=255) ttGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCAc  <  1:200751/62‑1 (MQ=255) ttGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCAc  <  1:173536/62‑1 (MQ=255) ttGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCAc  <  1:157125/62‑1 (MQ=255) ttGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCAc  <  1:1398103/62‑1 (MQ=255) ttGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCAc  <  1:1347337/62‑1 (MQ=255) ttGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCAc  <  1:1320379/62‑1 (MQ=255) ttGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCAc  <  1:1297031/62‑1 (MQ=255) ttGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCAc  <  1:1208651/62‑1 (MQ=255) ttGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCAc  <  1:1207445/62‑1 (MQ=255) ttGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCAc  <  1:1205726/62‑1 (MQ=255) ttGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCAc  <  1:1131553/62‑1 (MQ=255) ttGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCAc  <  1:110869/62‑1 (MQ=255)          tGCGCCGAGGAATCGCCACCAAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCAc  <  1:1458644/53‑1 (MQ=255)                                                              | TTGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAATTCCGGGAACATATCGGTCCAGGCTTCCAC  >  W3110S.gb/258900‑258961

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑