Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	291975	292045	71	20 [0]	[0] 27	yagK	conserved hypothetical protein

CGTTTATCCTCACGCACCTTACGGGTACGGTCAGCCTCCAGCTTAGCTCTGAGGGATTCACG  >  W3110S.gb/291913‑291974                                                              | cGTTTATCCTCACGCACCTTACGGGTACGGTCAGCCTCCAGCTTAGCTCTGAGGGATTCACg  <  1:155874/62‑1 (MQ=255) cGTTTATCCTCACGCACCTTACGGGTACGGTCAGCCTCCAGCTTAGCTCTGAGGGATTCACg  <  1:940294/62‑1 (MQ=255) cGTTTATCCTCACGCACCTTACGGGTACGGTCAGCCTCCAGCTTAGCTCTGAGGGATTCACg  <  1:613865/62‑1 (MQ=255) cGTTTATCCTCACGCACCTTACGGGTACGGTCAGCCTCCAGCTTAGCTCTGAGGGATTCACg  <  1:408984/62‑1 (MQ=255) cGTTTATCCTCACGCACCTTACGGGTACGGTCAGCCTCCAGCTTAGCTCTGAGGGATTCACg  <  1:366317/62‑1 (MQ=255) cGTTTATCCTCACGCACCTTACGGGTACGGTCAGCCTCCAGCTTAGCTCTGAGGGATTCACg  <  1:230219/62‑1 (MQ=255) cGTTTATCCTCACGCACCTTACGGGTACGGTCAGCCTCCAGCTTAGCTCTGAGGGATTCACg  <  1:210822/62‑1 (MQ=255) cGTTTATCCTCACGCACCTTACGGGTACGGTCAGCCTCCAGCTTAGCTCTGAGGGATTCACg  <  1:187469/62‑1 (MQ=255) cGTTTATCCTCACGCACCTTACGGGTACGGTCAGCCTCCAGCTTAGCTCTGAGGGATTCACg  <  1:162708/62‑1 (MQ=255) cGTTTATCCTCACGCACCTTACGGGTACGGTCAGCCTCCAGCTTAGCTCTGAGGGATTCACg  <  1:1020030/62‑1 (MQ=255) cGTTTATCCTCACGCACCTTACGGGTACGGTCAGCCTCCAGCTTAGCTCTGAGGGATTCACg  <  1:1472629/62‑1 (MQ=255) cGTTTATCCTCACGCACCTTACGGGTACGGTCAGCCTCCAGCTTAGCTCTGAGGGATTCACg  <  1:1468762/62‑1 (MQ=255) cGTTTATCCTCACGCACCTTACGGGTACGGTCAGCCTCCAGCTTAGCTCTGAGGGATTCACg  <  1:143873/62‑1 (MQ=255) cGTTTATCCTCACGCACCTTACGGGTACGGTCAGCCTCCAGCTTAGCTCTGAGGGATTCACg  <  1:1353045/62‑1 (MQ=255) cGTTTATCCTCACGCACCTTACGGGTACGGTCAGCCTCCAGCTTAGCTCTGAGGGATTCACg  <  1:1281057/62‑1 (MQ=255) cGTTTATCCTCACGCACCTTACGGGTACGGTCAGCCTCCAGCTTAGCTCTGAGGGATTCACg  <  1:1279365/62‑1 (MQ=255) cGTTTATCCTCACGCACCTTACGGGTACGGTCAGCCTCCAGCTTAGCTCTGAGGGATTCACg  <  1:1259431/62‑1 (MQ=255) cGTTTATCCTCACGCACCTTACGGGTACGGTCAGCCTCCAGCTTAGCTCTGAGGGATTCACg  <  1:1086061/62‑1 (MQ=255)  gTTTATCCTCACGCACCTTACGGGTACGGTCAGCCTCCAGCTTAGCTCTGAGGGATTCACg  <  1:491517/61‑1 (MQ=255)        ccTCACGCACCTTACGGGTACGGTCAGCCTCCAGCTTAGCTCTGAGGGATTCACg  <  1:1041007/55‑1 (MQ=255)                                                              | CGTTTATCCTCACGCACCTTACGGGTACGGTCAGCCTCCAGCTTAGCTCTGAGGGATTCACG  >  W3110S.gb/291913‑291974

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑