Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	335655	335725	71	33 [0]	[0] 6	yahE	hypothetical protein

GCAGTTATTCAGGCCGTAAACGATAAACAAAATATCGCCTCAGCGGTCGCCAGTATGATGGG  >  W3110S.gb/335593‑335654                                                              | gCAGTTATTCAGGCCGTAAACGTTAAACAAAATATCGCCTCAGCGGTCGCCAGTATGATggg  <  1:216358/62‑1 (MQ=255) gCAGTTATTCAGGCCGTAAACGATAAACAAAATATCGCCTCAGCGGTCGCCAGTATGATggg  <  1:381716/62‑1 (MQ=255) gCAGTTATTCAGGCCGTAAACGATAAACAAAATATCGCCTCAGCGGTCGCCAGTATGATggg  <  1:27139/62‑1 (MQ=255) gCAGTTATTCAGGCCGTAAACGATAAACAAAATATCGCCTCAGCGGTCGCCAGTATGATggg  <  1:295551/62‑1 (MQ=255) gCAGTTATTCAGGCCGTAAACGATAAACAAAATATCGCCTCAGCGGTCGCCAGTATGATggg  <  1:297298/62‑1 (MQ=255) gCAGTTATTCAGGCCGTAAACGATAAACAAAATATCGCCTCAGCGGTCGCCAGTATGATggg  <  1:31397/62‑1 (MQ=255) gCAGTTATTCAGGCCGTAAACGATAAACAAAATATCGCCTCAGCGGTCGCCAGTATGATggg  <  1:345210/62‑1 (MQ=255) gCAGTTATTCAGGCCGTAAACGATAAACAAAATATCGCCTCAGCGGTCGCCAGTATGATggg  <  1:359922/62‑1 (MQ=255) gCAGTTATTCAGGCCGTAAACGATAAACAAAATATCGCCTCAGCGGTCGCCAGTATGATggg  <  1:366478/62‑1 (MQ=255) gCAGTTATTCAGGCCGTAAACGATAAACAAAATATCGCCTCAGCGGTCGCCAGTATGATggg  <  1:247732/62‑1 (MQ=255) gCAGTTATTCAGGCCGTAAACGATAAACAAAATATCGCCTCAGCGGTCGCCAGTATGATggg  <  1:538994/62‑1 (MQ=255) gCAGTTATTCAGGCCGTAAACGATAAACAAAATATCGCCTCAGCGGTCGCCAGTATGATggg  <  1:607049/62‑1 (MQ=255) gCAGTTATTCAGGCCGTAAACGATAAACAAAATATCGCCTCAGCGGTCGCCAGTATGATggg  <  1:731370/62‑1 (MQ=255) gCAGTTATTCAGGCCGTAAACGATAAACAAAATATCGCCTCAGCGGTCGCCAGTATGATggg  <  1:873475/62‑1 (MQ=255) gCAGTTATTCAGGCCGTAAACGATAAACAAAATATCGCCTCAGCGGTCGCCAGTATGATggg  <  1:894780/62‑1 (MQ=255) gCAGTTATTCAGGCCGTAAACGATAAACAAAATATCGCCTCAGCGGTCGCCAGTATGATggg  <  1:968027/62‑1 (MQ=255) gCAGTTATTCAGGCCGTAAACGATAAACAAAATATCGCCTCAGCGGTCGCCAGTATGATggg  <  1:991546/62‑1 (MQ=255) gCAGTTATTCAGGCCGTAAACGATAAACAAAATATCGCCTCAGCGGTCGCCAGTATGATggg  <  1:263371/62‑1 (MQ=255) gCAGTTATTCAGGCCGTAAACGATAAACAAAATATCGCCTCAGCGGTCGCCAGTATGATggg  <  1:1020673/62‑1 (MQ=255) gCAGTTATTCAGGCCGTAAACGATAAACAAAATATCGCCTCAGCGGTCGCCAGTATGATggg  <  1:21405/62‑1 (MQ=255) gCAGTTATTCAGGCCGTAAACGATAAACAAAATATCGCCTCAGCGGTCGCCAGTATGATggg  <  1:152588/62‑1 (MQ=255) gCAGTTATTCAGGCCGTAAACGATAAACAAAATATCGCCTCAGCGGTCGCCAGTATGATggg  <  1:1436429/62‑1 (MQ=255) gCAGTTATTCAGGCCGTAAACGATAAACAAAATATCGCCTCAGCGGTCGCCAGTATGATggg  <  1:1311007/62‑1 (MQ=255) gCAGTTATTCAGGCCGTAAACGATAAACAAAATATCGCCTCAGCGGTCGCCAGTATGATggg  <  1:1231927/62‑1 (MQ=255) gCAGTTATTCAGGCCGTAAACGATAAACAAAATATCGCCTCAGCGGTCGCCAGTATGATggg  <  1:1216669/62‑1 (MQ=255) gCAGTTATTCAGGCCGTAAACGATAAACAAAATATCGCCTCAGCGGTCGCCAGTATGATggg  <  1:1194098/62‑1 (MQ=255) gCAGTTATTCAGGCCGTAAACGATAAACAAAATATCGCCTCAGCGGTCGCCAGTATGATggg  <  1:118248/62‑1 (MQ=255) gCAGTTATTCAGGCCGTAAACGATAAACAAAATATCGCCTCAGCGGTCGCCAGTATGATggg  <  1:1170661/62‑1 (MQ=255) gCAGTTATTCAGGCCGTAAACGATAAACAAAATATCGCCTCAGCGGTCGCCAGTATGATggg  <  1:1131356/62‑1 (MQ=255) gCAGTTATTCAGGCCGTAAACGATAAACAAAATATCGCCTCAGCGGTCGCCAGTATGATggg  <  1:1127265/62‑1 (MQ=255) gCAGTTATTCAGGCCGTAAACGATAAACAAAATATCGCCTCAGCGGTCGCCAGTATGATggg  <  1:1088369/62‑1 (MQ=255) gCAGTTATTCAGGCCGTAAACGATAAACAAAATATCGCCTCAGCGGTCGCCAGTATGATggg  <  1:1061530/62‑1 (MQ=255)  cAGTTATTCAGGCCGTAAACGATAAACAAAATATCGCCTCAGCGGTCGCCAGTATGATggg  <  1:1346677/61‑1 (MQ=255)                                                              | GCAGTTATTCAGGCCGTAAACGATAAACAAAATATCGCCTCAGCGGTCGCCAGTATGATGGG  >  W3110S.gb/335593‑335654

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑