Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	503236	503511	276	45 [0]	[0] 79	fsr	predicted fosmidomycin efflux system

ATAGCTGCTGATGCTCGCCATATAGAAATATTTCGAG‑AAAATGAGGATTAACAGAATGCTGA  >  W3110S.gb/503174‑503235                                                               | aTAGCTGCTGATGCTTGCCATATAGAAATATTTCGAG‑AAAATGAGGATTAACAGAATGCTGa  <  1:1163747/62‑1 (MQ=255) aTAGCTGCTGATGCTCGCCATATAGAAATATTTCGAG‑AAAATGAGGATTAACAGAATGCTGa  <  1:756234/62‑1 (MQ=255) aTAGCTGCTGATGCTCGCCATATAGAAATATTTCGAG‑AAAATGAGGATTAACAGAATGCTGa  <  1:408161/62‑1 (MQ=255) aTAGCTGCTGATGCTCGCCATATAGAAATATTTCGAG‑AAAATGAGGATTAACAGAATGCTGa  <  1:415336/62‑1 (MQ=255) aTAGCTGCTGATGCTCGCCATATAGAAATATTTCGAG‑AAAATGAGGATTAACAGAATGCTGa  <  1:424426/62‑1 (MQ=255) aTAGCTGCTGATGCTCGCCATATAGAAATATTTCGAG‑AAAATGAGGATTAACAGAATGCTGa  <  1:436908/62‑1 (MQ=255) aTAGCTGCTGATGCTCGCCATATAGAAATATTTCGAG‑AAAATGAGGATTAACAGAATGCTGa  <  1:444162/62‑1 (MQ=255) aTAGCTGCTGATGCTCGCCATATAGAAATATTTCGAG‑AAAATGAGGATTAACAGAATGCTGa  <  1:558681/62‑1 (MQ=255) aTAGCTGCTGATGCTCGCCATATAGAAATATTTCGAG‑AAAATGAGGATTAACAGAATGCTGa  <  1:571628/62‑1 (MQ=255) aTAGCTGCTGATGCTCGCCATATAGAAATATTTCGAG‑AAAATGAGGATTAACAGAATGCTGa  <  1:617657/62‑1 (MQ=255) aTAGCTGCTGATGCTCGCCATATAGAAATATTTCGAG‑AAAATGAGGATTAACAGAATGCTGa  <  1:636074/62‑1 (MQ=255) aTAGCTGCTGATGCTCGCCATATAGAAATATTTCGAG‑AAAATGAGGATTAACAGAATGCTGa  <  1:653382/62‑1 (MQ=255) aTAGCTGCTGATGCTCGCCATATAGAAATATTTCGAG‑AAAATGAGGATTAACAGAATGCTGa  <  1:348316/62‑1 (MQ=255) aTAGCTGCTGATGCTCGCCATATAGAAATATTTCGAG‑AAAATGAGGATTAACAGAATGCTGa  <  1:794741/62‑1 (MQ=255) aTAGCTGCTGATGCTCGCCATATAGAAATATTTCGAG‑AAAATGAGGATTAACAGAATGCTGa  <  1:802160/62‑1 (MQ=255) aTAGCTGCTGATGCTCGCCATATAGAAATATTTCGAG‑AAAATGAGGATTAACAGAATGCTGa  <  1:80611/62‑1 (MQ=255) aTAGCTGCTGATGCTCGCCATATAGAAATATTTCGAG‑AAAATGAGGATTAACAGAATGCTGa  <  1:848107/62‑1 (MQ=255) aTAGCTGCTGATGCTCGCCATATAGAAATATTTCGAG‑AAAATGAGGATTAACAGAATGCTGa  <  1:95653/62‑1 (MQ=255) aTAGCTGCTGATGCTCGCCATATAGAAATATTTCGAG‑AAAATGAGGATTAACAGAATGCTGa  <  1:958766/62‑1 (MQ=255) aTAGCTGCTGATGCTCGCCATATAGAAATATTTCGAG‑AAAATGAGGATTAACAGAATGCTGa  <  1:979425/62‑1 (MQ=255) aTAGCTGCTGATGCTCGCCATATAGAAATATTTCGAG‑AAAATGAGGATTAACAGAATGCTGa  <  1:988761/62‑1 (MQ=255) aTAGCTGCTGATGCTCGCCATATAGAAATATTTCGAG‑AAAATGAGGATTAACAGAATGCTGa  <  1:99002/62‑1 (MQ=255) aTAGCTGCTGATGCTCGCCATATAGAAATATTTCGAG‑AAAATGAGGATTAACAGAATGCTGa  <  1:1409010/62‑1 (MQ=255) aTAGCTGCTGATGCTCGCCATATAGAAATATTTCGAG‑AAAATGAGGATTAACAGAATGCTGa  <  1:1283733/62‑1 (MQ=255) aTAGCTGCTGATGCTCGCCATATAGAAATATTTCGAG‑AAAATGAGGATTAACAGAATGCTGa  <  1:128532/62‑1 (MQ=255) aTAGCTGCTGATGCTCGCCATATAGAAATATTTCGAG‑AAAATGAGGATTAACAGAATGCTGa  <  1:1320619/62‑1 (MQ=255) aTAGCTGCTGATGCTCGCCATATAGAAATATTTCGAG‑AAAATGAGGATTAACAGAATGCTGa  <  1:1323459/62‑1 (MQ=255) aTAGCTGCTGATGCTCGCCATATAGAAATATTTCGAG‑AAAATGAGGATTAACAGAATGCTGa  <  1:1263494/62‑1 (MQ=255) aTAGCTGCTGATGCTCGCCATATAGAAATATTTCGAG‑AAAATGAGGATTAACAGAATGCTGa  <  1:1387959/62‑1 (MQ=255) aTAGCTGCTGATGCTCGCCATATAGAAATATTTCGAG‑AAAATGAGGATTAACAGAATGCTGa  <  1:1195803/62‑1 (MQ=255) aTAGCTGCTGATGCTCGCCATATAGAAATATTTCGAG‑AAAATGAGGATTAACAGAATGCTGa  <  1:1406636/62‑1 (MQ=255) aTAGCTGCTGATGCTCGCCATATAGAAATATTTCGAG‑AAAATGAGGATTAACAGAATGCTGa  <  1:1429921/62‑1 (MQ=255) aTAGCTGCTGATGCTCGCCATATAGAAATATTTCGAG‑AAAATGAGGATTAACAGAATGCTGa  <  1:1448040/62‑1 (MQ=255) aTAGCTGCTGATGCTCGCCATATAGAAATATTTCGAG‑AAAATGAGGATTAACAGAATGCTGa  <  1:276343/62‑1 (MQ=255) aTAGCTGCTGATGCTCGCCATATAGAAATATTTCGAG‑AAAATGAGGATTAACAGAATGCTGa  <  1:30739/62‑1 (MQ=255) aTAGCTGCTGATGCTCGCCATATAGAAATATTTCGAG‑AAAATGAGGATTAACAGAATGCTGa  <  1:308444/62‑1 (MQ=255) aTAGCTGCTGATGCTCGCCATATAGAAATATTTCGAG‑AAAATGAGGATTAACAGAATGCTGa  <  1:32133/62‑1 (MQ=255) aTAGCTGCTGATGCTCGCCATATAGAAATATTTCGAG‑AAAATGAGGATTAACAGAATGCTGa  <  1:1128913/62‑1 (MQ=255) aTAGCTGCTGATGCTCGCCATATAGAAATATTTCGAG‑AAAATGAGGATTAACAGAATGCTGa  <  1:1104798/62‑1 (MQ=255)  tAGCTGCTGATGCTCGCCATATAGAAATATTTCGAG‑AAAATGAGGATTAACAGAATGCTGa  <  1:393659/61‑1 (MQ=255)  tAGCTGCTGATGCTCGCCATATAGAAATATTTCGAG‑AAAATGAGGATTAACAGAATGCTGa  <  1:1398128/61‑1 (MQ=255)  tAGCTGCTGATGCTCGCCATATAGAAATATTTCGAG‑AAAATGAGGATTAACAGAATGCTGa  <  1:347319/61‑1 (MQ=255)  tAGCTGCTGATGCTCGCCATATAGAAATATTTCGAG‑AAAATGAGGATTAACAGAATGCTGa  <  1:1017720/61‑1 (MQ=255)   aGCTGCTGATGCTCGCCATATAGAAATATTTCGAGAAAAATGAGGATTAACAGAATGCTGa  <  1:101996/61‑1 (MQ=255)     ctgctgATGCTCGCCATATAGAAATATTTCGAG‑AAAATGAGGATTAACAGAATGCTGa  <  1:78077/58‑1 (MQ=255)                                                               | ATAGCTGCTGATGCTCGCCATATAGAAATATTTCGAG‑AAAATGAGGATTAACAGAATGCTGA  >  W3110S.gb/503174‑503235

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑