Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	600213	600346	134	63 [2]	[0] 16	cusA	copper/silver efflux system, membrane component

CGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAACGGTGGAA  >  W3110S.gb/600158‑600219                                                       |        cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCTAAAc         >  1:723689/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:1011664/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:392221/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:394391/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:401712/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:403886/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:439203/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:443725/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:450409/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:484167/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:509908/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:587674/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:649445/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:675186/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:696351/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:697628/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:726625/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:755947/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:813163/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:8379/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:843377/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:853553/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:871144/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:877865/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:918243/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:927240/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:936706/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:967764/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:969346/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:998419/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:384904/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:1014280/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:1038493/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:1038503/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:1048294/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:1061394/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:1137461/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:1175760/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:1194570/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:122741/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:1230509/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:1249431/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:1266891/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:137346/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:1382742/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:1428410/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:22613/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:388588/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:380182/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:33954/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:334468/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:321345/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:253090/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:189574/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:178026/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:167626/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:1440810/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:1433325/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAACGGTAGat  >  1:1430086/1‑61 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAACGGTAGat  >  1:1064129/1‑61 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTCGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:588133/1‑55 (MQ=255) cGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTG‑GGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:614487/1‑54 (MQ=255) cGGATCTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAAc         >  1:428373/1‑55 (MQ=255)                                                       |        CGGATGTGCAGTTGTTTGTGACTTCTGCGGTGGGCGGGGCGATGGTTGGCGAAACGGTGGAA  >  W3110S.gb/600158‑600219

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑