Missing coverage evidence...
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ATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTT  >  W3110S.gb/622730‑622791                                                              | aTTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCtt  <  1:434251/62‑1 (MQ=255) aTTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCtt  <  1:961275/62‑1 (MQ=255) aTTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCtt  <  1:905497/62‑1 (MQ=255) aTTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCtt  <  1:844283/62‑1 (MQ=255) aTTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCtt  <  1:797647/62‑1 (MQ=255) aTTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCtt  <  1:788250/62‑1 (MQ=255) aTTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCtt  <  1:721697/62‑1 (MQ=255) aTTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCtt  <  1:72084/62‑1 (MQ=255) aTTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCtt  <  1:719676/62‑1 (MQ=255) aTTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCtt  <  1:606543/62‑1 (MQ=255) aTTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCtt  <  1:597966/62‑1 (MQ=255) aTTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCtt  <  1:537690/62‑1 (MQ=255) aTTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCtt  <  1:537226/62‑1 (MQ=255) aTTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCtt  <  1:452486/62‑1 (MQ=255) aTTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCtt  <  1:449971/62‑1 (MQ=255) aTTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCtt  <  1:421761/62‑1 (MQ=255) aTTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCtt  <  1:420045/62‑1 (MQ=255) aTTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCtt  <  1:418684/62‑1 (MQ=255) aTTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCtt  <  1:41433/62‑1 (MQ=255) aTTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCtt  <  1:323853/62‑1 (MQ=255) aTTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCtt  <  1:219555/62‑1 (MQ=255) aTTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCtt  <  1:202687/62‑1 (MQ=255) aTTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCtt  <  1:1381332/62‑1 (MQ=255) aTTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCtt  <  1:1033287/62‑1 (MQ=255) aTTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCtt  <  1:1032020/62‑1 (MQ=255) aTTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCtt  <  1:1007552/62‑1 (MQ=255)  ttttCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCtt  <  1:100013/61‑1 (MQ=255)  ttttCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCtt  <  1:41410/61‑1 (MQ=255)  ttttCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCtt  <  1:1360207/61‑1 (MQ=255)      cGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCtt  <  1:1392977/57‑1 (MQ=255)                                                              | ATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTT  >  W3110S.gb/622730‑622791

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑