Missing coverage evidence...
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GCGGTTATTCGGCGTGGTCGCGCCGCTGGCGATCACCGGAGCATCAATCGCCAGCAGTGAGC  >  W3110S.gb/623500‑623561                                                              | gcgGTTATTCGGCGTGGTCGCGCCGCTGGCGATCACCGGAGCATCAATCGCCAGCATTGAGc  <  1:329317/62‑1 (MQ=255) gcgGTTATTCGGCGTGGTCGCGCCGCTGGCGATCACCGGAGCATCAATCGCCAGCAGTGAGc  <  1:20783/62‑1 (MQ=255) gcgGTTATTCGGCGTGGTCGCGCCGCTGGCGATCACCGGAGCATCAATCGCCAGCAGTGAGc  <  1:950145/62‑1 (MQ=255) gcgGTTATTCGGCGTGGTCGCGCCGCTGGCGATCACCGGAGCATCAATCGCCAGCAGTGAGc  <  1:93412/62‑1 (MQ=255) gcgGTTATTCGGCGTGGTCGCGCCGCTGGCGATCACCGGAGCATCAATCGCCAGCAGTGAGc  <  1:88276/62‑1 (MQ=255) gcgGTTATTCGGCGTGGTCGCGCCGCTGGCGATCACCGGAGCATCAATCGCCAGCAGTGAGc  <  1:834707/62‑1 (MQ=255) gcgGTTATTCGGCGTGGTCGCGCCGCTGGCGATCACCGGAGCATCAATCGCCAGCAGTGAGc  <  1:597925/62‑1 (MQ=255) gcgGTTATTCGGCGTGGTCGCGCCGCTGGCGATCACCGGAGCATCAATCGCCAGCAGTGAGc  <  1:579269/62‑1 (MQ=255) gcgGTTATTCGGCGTGGTCGCGCCGCTGGCGATCACCGGAGCATCAATCGCCAGCAGTGAGc  <  1:573568/62‑1 (MQ=255) gcgGTTATTCGGCGTGGTCGCGCCGCTGGCGATCACCGGAGCATCAATCGCCAGCAGTGAGc  <  1:543820/62‑1 (MQ=255) gcgGTTATTCGGCGTGGTCGCGCCGCTGGCGATCACCGGAGCATCAATCGCCAGCAGTGAGc  <  1:54170/62‑1 (MQ=255) gcgGTTATTCGGCGTGGTCGCGCCGCTGGCGATCACCGGAGCATCAATCGCCAGCAGTGAGc  <  1:426353/62‑1 (MQ=255) gcgGTTATTCGGCGTGGTCGCGCCGCTGGCGATCACCGGAGCATCAATCGCCAGCAGTGAGc  <  1:395260/62‑1 (MQ=255) gcgGTTATTCGGCGTGGTCGCGCCGCTGGCGATCACCGGAGCATCAATCGCCAGCAGTGAGc  <  1:363609/62‑1 (MQ=255) gcgGTTATTCGGCGTGGTCGCGCCGCTGGCGATCACCGGAGCATCAATCGCCAGCAGTGAGc  <  1:35712/62‑1 (MQ=255) gcgGTTATTCGGCGTGGTCGCGCCGCTGGCGATCACCGGAGCATCAATCGCCAGCAGTGAGc  <  1:229961/62‑1 (MQ=255) gcgGTTATTCGGCGTGGTCGCGCCGCTGGCGATCACCGGAGCATCAATCGCCAGCAGTGAGc  <  1:1282452/62‑1 (MQ=255) gcgGTTATTCGGCGTGGTCGCGCCGCTGGCGATCACCGGAGCATCAATCGCCAGCAGTGAGc  <  1:1092870/62‑1 (MQ=255) gcgGTTATTCGGCGTGGTCGCGCCGCTGGCGATCACCGGAGCATCAATCGCCAGCAGTGAGc  <  1:1099356/62‑1 (MQ=255) gcgGTTATTCGGCGTGGTCGCGCCGCTGGCGATCACCGGAGCATCAATCGCCAGCAGTGAGc  <  1:11097/62‑1 (MQ=255) gcgGTTATTCGGCGTGGTCGCGCCGCTGGCGATCACCGGAGCATCAATCGCCAGCAGTGAGc  <  1:1117499/62‑1 (MQ=255) gcgGTTATTCGGCGTGGTCGCGCCGCTGGCGATCACCGGAGCATCAATCGCCAGCAGTGAGc  <  1:1118900/62‑1 (MQ=255) gcgGTTATTCGGCGTGGTCGCGCCGCTGGCGATCACCGGAGCATCAATCGCCAGCAGTGAGc  <  1:1126886/62‑1 (MQ=255) gcgGTTATTCGGCGTGGTCGCGCCGCTGGCGATCACCGGAGCATCAATCGCCAGCAGTGAGc  <  1:1234085/62‑1 (MQ=255) gcgGTTATTCGGCGTGGTCGCGCCGCTGGCGATCACCGGAGCATCAATCGCCAGCAGTGAGc  <  1:1247972/62‑1 (MQ=255) gcgGTTATTCGGCGTGGTCGCGCCGCTGGCGATCACCGGAGCATCAATCGCCAGCAGTGAGc  <  1:161152/62‑1 (MQ=255) gcgGTTATTCGGCGTGGTCGCGCCGCTGGCGATCACCGGAGCATCAATCGCCAGCAGTGAGc  <  1:1398369/62‑1 (MQ=255) gcgGTTATTCGGCGTGGTCGCGCCGCTGGCGATCACCGGAGCATCAATCGCCAGCAGTGAGc  <  1:1406521/62‑1 (MQ=255) gcgGTTATTCGGCGTGGTCGCGCCGCTGGCGATCACCGGAGCATCAATCGCCAGCAGTGAGc  <  1:1448077/62‑1 (MQ=255) gcgGTTATTCGGCGTGGTCGCGCCGCTGGCGATCACCGGAGCATCAATCGCCAGCAGTGAGc  <  1:144934/62‑1 (MQ=255) gcgGTTATTCGGCGTGGGCGCGCCGCTGGCGATCACCGGAGCATCAATCGCCAGCAGTGAGc  <  1:281159/62‑1 (MQ=255)  cgGTTATTCGGCGTGGTCGCGCCGCTGGCGATCACCGGAGCATCAATCGCCAGCAGTGAGc  <  1:1426349/61‑1 (MQ=255)  cgGTTATTCGGCGTGGTCGCGCCGCTGGCGATCACCGGAGCATCAATCGCCAGCAGTGAGc  <  1:868376/61‑1 (MQ=255)  cgGTTATTCGGCGTGGTCGCGCCGCTGGCGATCACCGGAGCATCAATCGCCAGCAGTGAGc  <  1:1022610/61‑1 (MQ=255)  cgGTTATTCGGCGTGGTCGCGCCGCTGGCGATCACCGGAGCATCAATCGCCAGCAGTGAGc  <  1:165499/61‑1 (MQ=255)                    gcgcCGCTGGCGATCACCGGAGCATCAATCGCCAGCAGTGAGc  <  1:835873/43‑1 (MQ=255)                        cgcTGGCGATCACCGGAGCATCAATCGCCAGCAGTGAGc  <  1:1416976/39‑1 (MQ=255)                                                              | GCGGTTATTCGGCGTGGTCGCGCCGCTGGCGATCACCGGAGCATCAATCGCCAGCAGTGAGC  >  W3110S.gb/623500‑623561

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑