Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	689528	689746	219	73 [0]	[0] 34	insH/lnt	IS5 transposase and trans‑activator/apolipoprotein N‑acyltransferase

TTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGC  >  W3110S.gb/689479‑689527                                                 | ttAGTTTGGCTATATGTTAAGATATTGCTGTTTTTTTGTTTGTTTTTGc  >  1:691759/1‑49 (MQ=38) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:419138/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:627534/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:618171/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:602212/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:584022/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:532404/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:522275/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:464051/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:455865/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:643972/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:386942/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:354727/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:349385/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:345011/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:341646/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:329095/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:313839/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:311166/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:775008/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:992530/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:948000/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:911031/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:873783/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:827029/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:822399/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:814622/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:807557/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:635482/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:760694/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:758097/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:743589/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:731997/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:69076/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:668504/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:66438/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:306121/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:1248599/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:137354/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:1367100/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:1351136/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:1341828/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:1310911/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:1302145/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:1297595/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:1276717/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:1403840/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:1240326/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:1207666/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:1204620/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:1182916/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:1115665/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:1101960/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:1101582/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:1088249/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:188077/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:303432/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:282918/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:265679/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:223257/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:213793/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:209481/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:190418/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:1072469/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:168720/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:1465387/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:1452361/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:1447211/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:1431564/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:1416858/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:1406862/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTCTGc  >  1:143546/1‑49 (MQ=255) ttAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGATGTTTTATTGTTTGTTTTTGc  >  1:299052/1‑49 (MQ=255)                                                 | TTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATTGTTTGTTTTTGC  >  W3110S.gb/689479‑689527

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑