Missing coverage evidence...
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ATACCCGACTGTACTTTGATGTAGCCGTTTTCCAGTTCCAGCTGCCCTTCGAAAATCG  >  W3110S.gb/931664‑931721                                                          | aTACCCGACTGTACTTTGATGTAGCCGTTTTCCAGTTCCAGGTGCCCTTCGAAAATCg  >  1:861052/1‑58 (MQ=255) aTACCCGACTGTACTTTGATGTAGCCGTTTTCCAGTTCCAGCTGCCCTTCGAAAATCg  >  1:685967/1‑58 (MQ=255) aTACCCGACTGTACTTTGATGTAGCCGTTTTCCAGTTCCAGCTGCCCTTCGAAAATCg  >  1:1019310/1‑58 (MQ=255) aTACCCGACTGTACTTTGATGTAGCCGTTTTCCAGTTCCAGCTGCCCTTCGAAAATCg  >  1:411741/1‑58 (MQ=255) aTACCCGACTGTACTTTGATGTAGCCGTTTTCCAGTTCCAGCTGCCCTTCGAAAATCg  >  1:449293/1‑58 (MQ=255) aTACCCGACTGTACTTTGATGTAGCCGTTTTCCAGTTCCAGCTGCCCTTCGAAAATCg  >  1:488976/1‑58 (MQ=255) aTACCCGACTGTACTTTGATGTAGCCGTTTTCCAGTTCCAGCTGCCCTTCGAAAATCg  >  1:520884/1‑58 (MQ=255) aTACCCGACTGTACTTTGATGTAGCCGTTTTCCAGTTCCAGCTGCCCTTCGAAAATCg  >  1:566047/1‑58 (MQ=255) aTACCCGACTGTACTTTGATGTAGCCGTTTTCCAGTTCCAGCTGCCCTTCGAAAATCg  >  1:6161/1‑58 (MQ=255) aTACCCGACTGTACTTTGATGTAGCCGTTTTCCAGTTCCAGCTGCCCTTCGAAAATCg  >  1:646963/1‑58 (MQ=255) aTACCCGACTGTACTTTGATGTAGCCGTTTTCCAGTTCCAGCTGCCCTTCGAAAATCg  >  1:370964/1‑58 (MQ=255) aTACCCGACTGTACTTTGATGTAGCCGTTTTCCAGTTCCAGCTGCCCTTCGAAAATCg  >  1:704302/1‑58 (MQ=255) aTACCCGACTGTACTTTGATGTAGCCGTTTTCCAGTTCCAGCTGCCCTTCGAAAATCg  >  1:704857/1‑58 (MQ=255) aTACCCGACTGTACTTTGATGTAGCCGTTTTCCAGTTCCAGCTGCCCTTCGAAAATCg  >  1:744707/1‑58 (MQ=255) aTACCCGACTGTACTTTGATGTAGCCGTTTTCCAGTTCCAGCTGCCCTTCGAAAATCg  >  1:747856/1‑58 (MQ=255) aTACCCGACTGTACTTTGATGTAGCCGTTTTCCAGTTCCAGCTGCCCTTCGAAAATCg  >  1:93951/1‑58 (MQ=255) aTACCCGACTGTACTTTGATGTAGCCGTTTTCCAGTTCCAGCTGCCCTTCGAAAATCg  >  1:96052/1‑58 (MQ=255) aTACCCGACTGTACTTTGATGTAGCCGTTTTCCAGTTCCAGCTGCCCTTCGAAAATCg  >  1:1333768/1‑58 (MQ=255) aTACCCGACTGTACTTTGATGTAGCCGTTTTCCAGTTCCAGCTGCCCTTCGAAAATCg  >  1:1058394/1‑58 (MQ=255) aTACCCGACTGTACTTTGATGTAGCCGTTTTCCAGTTCCAGCTGCCCTTCGAAAATCg  >  1:1066520/1‑58 (MQ=255) aTACCCGACTGTACTTTGATGTAGCCGTTTTCCAGTTCCAGCTGCCCTTCGAAAATCg  >  1:1079918/1‑58 (MQ=255) aTACCCGACTGTACTTTGATGTAGCCGTTTTCCAGTTCCAGCTGCCCTTCGAAAATCg  >  1:1160731/1‑58 (MQ=255) aTACCCGACTGTACTTTGATGTAGCCGTTTTCCAGTTCCAGCTGCCCTTCGAAAATCg  >  1:1164568/1‑58 (MQ=255) aTACCCGACTGTACTTTGATGTAGCCGTTTTCCAGTTCCAGCTGCCCTTCGAAAATCg  >  1:1228810/1‑58 (MQ=255) aTACCCGACTGTACTTTGATGTAGCCGTTTTCCAGTTCCAGCTGCCCTTCGAAAATCg  >  1:128721/1‑58 (MQ=255) aTACCCGACTGTACTTTGATGTAGCCGTTTTCCAGTTCCAGCTGCCCTTCGAAAATCg  >  1:1320639/1‑58 (MQ=255) aTACCCGACTGTACTTTGATGTAGCCGTTTTCCAGTTCCAGCTGCCCTTCGAAAATCg  >  1:351606/1‑58 (MQ=255) aTACCCGACTGTACTTTGATGTAGCCGTTTTCCAGTTCCAGCTGCCCTTCGAAAATCg  >  1:1352114/1‑58 (MQ=255) aTACCCGACTGTACTTTGATGTAGCCGTTTTCCAGTTCCAGCTGCCCTTCGAAAATCg  >  1:1384049/1‑58 (MQ=255) aTACCCGACTGTACTTTGATGTAGCCGTTTTCCAGTTCCAGCTGCCCTTCGAAAATCg  >  1:1401956/1‑58 (MQ=255) aTACCCGACTGTACTTTGATGTAGCCGTTTTCCAGTTCCAGCTGCCCTTCGAAAATCg  >  1:170247/1‑58 (MQ=255) aTACCCGACTGTACTTTGATGTAGCCGTTTTCCAGTTCCAGCTGCCCTTCGAAAATCg  >  1:348934/1‑58 (MQ=255) aTACCCGACTGTACTTTGATGTAGCCGTTTTCCAGTTCCAGCTGCCCTTAGAAAATCg  >  1:419749/1‑58 (MQ=255) aTACCCGACTGTACTTTGATGTAGCCGTTATCCAGTTCCAGCTGCCCTTCGAAAATCg  >  1:1411457/1‑58 (MQ=255)                                                          | ATACCCGACTGTACTTTGATGTAGCCGTTTTCCAGTTCCAGCTGCCCTTCGAAAATCG  >  W3110S.gb/931664‑931721

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑