Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	962381	962729	349	55 [3]	[0] 45	[rpsA]	[rpsA]

CAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAGCCAGGTGGACG  >  W3110S.gb/962320‑962391                                                             |            cAGTACTCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:894700/61‑1 (MQ=255) cAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCTGCATGGAg             <  1:388134/61‑1 (MQ=255) cAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:737427/61‑1 (MQ=255) cAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:526447/61‑1 (MQ=255) cAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:567257/61‑1 (MQ=255) cAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:585700/61‑1 (MQ=255) cAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:60831/61‑1 (MQ=255) cAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:620433/61‑1 (MQ=255) cAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:662142/61‑1 (MQ=255) cAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:680762/61‑1 (MQ=255) cAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:687679/61‑1 (MQ=255) cAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:692337/61‑1 (MQ=255) cAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:717996/61‑1 (MQ=255) cAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:736871/61‑1 (MQ=255) cAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:552632/61‑1 (MQ=255) cAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:744630/61‑1 (MQ=255) cAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:749908/61‑1 (MQ=255) cAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:759097/61‑1 (MQ=255) cAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:790985/61‑1 (MQ=255) cAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:825642/61‑1 (MQ=255) cAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:874990/61‑1 (MQ=255) cAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:915377/61‑1 (MQ=255) cAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:972599/61‑1 (MQ=255) cAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:97499/61‑1 (MQ=255) cAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:988989/61‑1 (MQ=255) cAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:991712/61‑1 (MQ=255) cAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:135384/61‑1 (MQ=255) cAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:1047922/61‑1 (MQ=255) cAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:1079799/61‑1 (MQ=255) cAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:1096097/61‑1 (MQ=255) cAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:1106422/61‑1 (MQ=255) cAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:1231828/61‑1 (MQ=255) cAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:1258456/61‑1 (MQ=255) cAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:1262564/61‑1 (MQ=255) cAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:1290476/61‑1 (MQ=255) cAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:1351910/61‑1 (MQ=255) cAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:1352111/61‑1 (MQ=255) cAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:475614/61‑1 (MQ=255) cAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:1364464/61‑1 (MQ=255) cAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:1414082/61‑1 (MQ=255) cAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:147343/61‑1 (MQ=255) cAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:188142/61‑1 (MQ=255) cAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:207060/61‑1 (MQ=255) cAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:273039/61‑1 (MQ=255) cAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:295022/61‑1 (MQ=255) cAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:306853/61‑1 (MQ=255) cAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:369616/61‑1 (MQ=255) cAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:37162/61‑1 (MQ=255)  aGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:717545/60‑1 (MQ=255)  aGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:816559/60‑1 (MQ=255)  aGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:905181/60‑1 (MQ=255)            ttGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAGCCAGGTGGAc   >  1:1131407/1‑60 (MQ=255)            ttGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAGCCAGGTGGACg  >  1:25998/1‑61 (MQ=255)            ttGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAGCCAGGTGGACg  >  1:1006507/1‑61 (MQ=255)                           aGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAg             <  1:844155/35‑1 (MQ=255)                                                             |            CAGTACCCCCGTTGCAATGGAATGACAGCGGGTATGTTAAACAACCCCATCCGGCATGGAGCCAGGTGGACG  >  W3110S.gb/962320‑962391

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑