Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	965274	965429	156	51 [0]	[0] 61	ycaI	conserved inner membrane protein

TCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTG  >  W3110S.gb/965212‑965273                                                              | tCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:692381/62‑1 (MQ=255) tCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:173091/62‑1 (MQ=255) tCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:1060749/62‑1 (MQ=255) tCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:287607/62‑1 (MQ=255) tCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:322144/62‑1 (MQ=255) tCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:339144/62‑1 (MQ=255) tCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:392296/62‑1 (MQ=255) tCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:400058/62‑1 (MQ=255) tCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:476043/62‑1 (MQ=255) tCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:517405/62‑1 (MQ=255) tCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:571663/62‑1 (MQ=255) tCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:28581/62‑1 (MQ=255) tCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:71032/62‑1 (MQ=255) tCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:728402/62‑1 (MQ=255) tCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:755256/62‑1 (MQ=255) tCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:828200/62‑1 (MQ=255) tCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:863244/62‑1 (MQ=255) tCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:879388/62‑1 (MQ=255) tCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:898997/62‑1 (MQ=255) tCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:965345/62‑1 (MQ=255) tCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:991181/62‑1 (MQ=255) tCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:1267532/62‑1 (MQ=255) tCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:1194564/62‑1 (MQ=255) tCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:1201567/62‑1 (MQ=255) tCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:1206860/62‑1 (MQ=255) tCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:1218297/62‑1 (MQ=255) tCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:1469382/62‑1 (MQ=255) tCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:1228026/62‑1 (MQ=255) tCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:1234095/62‑1 (MQ=255) tCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:1176716/62‑1 (MQ=255) tCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:1298046/62‑1 (MQ=255) tCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:1147572/62‑1 (MQ=255) tCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:1118850/62‑1 (MQ=255) tCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:1108051/62‑1 (MQ=255) tCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:1441919/62‑1 (MQ=255) tCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:1105378/62‑1 (MQ=255) tCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:1066634/62‑1 (MQ=255) tCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGGCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:669852/62‑1 (MQ=255) tCAGCCGCTCACCGGCCGCTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:270715/62‑1 (MQ=255)  cAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:857592/61‑1 (MQ=255)  cAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:61941/61‑1 (MQ=255)  cAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:768503/61‑1 (MQ=255)  cAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:1266094/61‑1 (MQ=255)  cAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:456527/61‑1 (MQ=255)  cAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:127679/61‑1 (MQ=255)  cAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:1332866/61‑1 (MQ=255)  cAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:289692/61‑1 (MQ=255)  cAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:1379796/61‑1 (MQ=255)  cAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:221735/61‑1 (MQ=255)  cAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:178096/61‑1 (MQ=255)           aCCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGAGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTg  <  1:939403/52‑1 (MQ=255)                                                              | TCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTG  >  W3110S.gb/965212‑965273

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑