Missing coverage evidence...
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TTGGTTTTTGCTACGCCTCCCGTGAAGATCAGTTTTGATCCCGGATTTTCGCGCCATAA  >  W3110S.gb/973423‑973481                                                           | ttGGTTTTTGCTACGCCTCCCGTGAAGATCAGTTTTGATCCCGGATTTTCGCGCCATaa  <  1:751905/59‑1 (MQ=255) ttGGTTTTTGCTACGCCTCCCGTGAAGATCAGTTTTGATCCCGGATTTTCGCGCCATaa  <  1:340789/59‑1 (MQ=255) ttGGTTTTTGCTACGCCTCCCGTGAAGATCAGTTTTGATCCCGGATTTTCGCGCCATaa  <  1:426335/59‑1 (MQ=255) ttGGTTTTTGCTACGCCTCCCGTGAAGATCAGTTTTGATCCCGGATTTTCGCGCCATaa  <  1:428901/59‑1 (MQ=255) ttGGTTTTTGCTACGCCTCCCGTGAAGATCAGTTTTGATCCCGGATTTTCGCGCCATaa  <  1:597232/59‑1 (MQ=255) ttGGTTTTTGCTACGCCTCCCGTGAAGATCAGTTTTGATCCCGGATTTTCGCGCCATaa  <  1:606468/59‑1 (MQ=255) ttGGTTTTTGCTACGCCTCCCGTGAAGATCAGTTTTGATCCCGGATTTTCGCGCCATaa  <  1:611710/59‑1 (MQ=255) ttGGTTTTTGCTACGCCTCCCGTGAAGATCAGTTTTGATCCCGGATTTTCGCGCCATaa  <  1:648941/59‑1 (MQ=255) ttGGTTTTTGCTACGCCTCCCGTGAAGATCAGTTTTGATCCCGGATTTTCGCGCCATaa  <  1:67367/59‑1 (MQ=255) ttGGTTTTTGCTACGCCTCCCGTGAAGATCAGTTTTGATCCCGGATTTTCGCGCCATaa  <  1:278049/59‑1 (MQ=255) ttGGTTTTTGCTACGCCTCCCGTGAAGATCAGTTTTGATCCCGGATTTTCGCGCCATaa  <  1:775436/59‑1 (MQ=255) ttGGTTTTTGCTACGCCTCCCGTGAAGATCAGTTTTGATCCCGGATTTTCGCGCCATaa  <  1:811333/59‑1 (MQ=255) ttGGTTTTTGCTACGCCTCCCGTGAAGATCAGTTTTGATCCCGGATTTTCGCGCCATaa  <  1:83368/59‑1 (MQ=255) ttGGTTTTTGCTACGCCTCCCGTGAAGATCAGTTTTGATCCCGGATTTTCGCGCCATaa  <  1:861578/59‑1 (MQ=255) ttGGTTTTTGCTACGCCTCCCGTGAAGATCAGTTTTGATCCCGGATTTTCGCGCCATaa  <  1:880426/59‑1 (MQ=255) ttGGTTTTTGCTACGCCTCCCGTGAAGATCAGTTTTGATCCCGGATTTTCGCGCCATaa  <  1:920412/59‑1 (MQ=255) ttGGTTTTTGCTACGCCTCCCGTGAAGATCAGTTTTGATCCCGGATTTTCGCGCCATaa  <  1:952657/59‑1 (MQ=255) ttGGTTTTTGCTACGCCTCCCGTGAAGATCAGTTTTGATCCCGGATTTTCGCGCCATaa  <  1:1023946/59‑1 (MQ=255) ttGGTTTTTGCTACGCCTCCCGTGAAGATCAGTTTTGATCCCGGATTTTCGCGCCATaa  <  1:263838/59‑1 (MQ=255) ttGGTTTTTGCTACGCCTCCCGTGAAGATCAGTTTTGATCCCGGATTTTCGCGCCATaa  <  1:242622/59‑1 (MQ=255) ttGGTTTTTGCTACGCCTCCCGTGAAGATCAGTTTTGATCCCGGATTTTCGCGCCATaa  <  1:215619/59‑1 (MQ=255) ttGGTTTTTGCTACGCCTCCCGTGAAGATCAGTTTTGATCCCGGATTTTCGCGCCATaa  <  1:1418405/59‑1 (MQ=255) ttGGTTTTTGCTACGCCTCCCGTGAAGATCAGTTTTGATCCCGGATTTTCGCGCCATaa  <  1:1414097/59‑1 (MQ=255) ttGGTTTTTGCTACGCCTCCCGTGAAGATCAGTTTTGATCCCGGATTTTCGCGCCATaa  <  1:1346509/59‑1 (MQ=255) ttGGTTTTTGCTACGCCTCCCGTGAAGATCAGTTTTGATCCCGGATTTTCGCGCCATaa  <  1:1314421/59‑1 (MQ=255) ttGGTTTTTGCTACGCCTCCCGTGAAGATCAGTTTTGATCCCGGATTTTCGCGCCATaa  <  1:1306970/59‑1 (MQ=255) ttGGTTTTTGCTACGCCTCCCGTGAAGATCAGTTTTGATCCCGGATTTTCGCGCCATaa  <  1:1259471/59‑1 (MQ=255) ttGGTTTTTGCTACGCCTCCCGTGAAGATCAGTTTTGATCCCGGATTTTCGCGCCATaa  <  1:1178715/59‑1 (MQ=255) ttGGTTTTTGCTACGCCTCCCGTGAAGATCAGTTTTGATCCCGGATTTTCGCGCCATaa  <  1:1170798/59‑1 (MQ=255) ttGGTTTTTGCTACGCCTCCCGTGAAGATCAGTTTTGATCCCGGATTTTCGCGCCATaa  <  1:1143026/59‑1 (MQ=255) ttGGTTTTTGCTACGCCTCCCGTGAAGATCAGTTTTGATCCCGGATTTTCGCGCCATaa  <  1:1118249/59‑1 (MQ=255) ttGGTTTTTGCTACGCCTCCCGTGAAGATCAGTTTTGATCCCGGATTTTCGCGCCATaa  <  1:1091025/59‑1 (MQ=255) ttGGTTTTTGCTACGCCTCCCGTGAAGATCAGTTTTGATCCCGGATTTTCGCGCCATaa  <  1:1037161/59‑1 (MQ=255)                                                           | TTGGTTTTTGCTACGCCTCCCGTGAAGATCAGTTTTGATCCCGGATTTTCGCGCCATAA  >  W3110S.gb/973423‑973481

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑