Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	998954	998968	15	13 [0]	[0] 43	ycbR	predicted periplasmic pilin chaperone

TTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTA  >  W3110S.gb/998892‑998953                                                              | ttttttAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTa  <  1:1080818/62‑1 (MQ=255) ttttttAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTa  <  1:1145002/62‑1 (MQ=255) ttttttAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTa  <  1:1158216/62‑1 (MQ=255) ttttttAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTa  <  1:1344094/62‑1 (MQ=255) ttttttAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTa  <  1:1460386/62‑1 (MQ=255) ttttttAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTa  <  1:1471262/62‑1 (MQ=255) ttttttAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTa  <  1:151090/62‑1 (MQ=255) ttttttAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTa  <  1:497771/62‑1 (MQ=255) ttttttAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTa  <  1:647491/62‑1 (MQ=255) ttttttAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTa  <  1:707053/62‑1 (MQ=255)  tttttAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTa  <  1:1192444/61‑1 (MQ=255)  tttttAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTa  <  1:430614/61‑1 (MQ=255)  tttttAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTa  <  1:901883/61‑1 (MQ=255)                                                              | TTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTA  >  W3110S.gb/998892‑998953

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑