Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1041685	1041692	8	71 [0]	[0] 57	appA	phosphoanhydride phosphorylase

GTGCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAT  >  W3110S.gb/1041635‑1041684                                                  | gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:577508/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:703357/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:668875/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:663296/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:654783/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:638851/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:606470/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:591822/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:587501/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:747747/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:515562/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:448127/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:389749/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:341261/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:324139/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:289343/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:23873/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:197176/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:880521/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:94207/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:933739/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:930188/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:923084/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:916277/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:896183/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:893327/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:890488/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:179868/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:874659/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:850889/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:841590/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:808841/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:799433/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:777553/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:760846/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:748306/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:1095025/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:1271445/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:1262581/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:1242198/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:1232754/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:1229051/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:1213458/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:114205/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:1100669/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:1294135/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:1077013/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:1074908/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:1059780/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:105008/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:1030830/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:1025358/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:1014968/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:1005362/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:1413458/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:179121/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:174903/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:1451751/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:144801/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:1442887/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:1437065/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:1425191/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:1417852/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:1001089/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:1383965/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:1376234/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:1363838/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:1332159/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:1331828/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:1317899/1‑50 (MQ=255) gtgCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAt  >  1:1294899/1‑50 (MQ=255)                                                  | GTGCCTTAAACGTGAGAAACAGGACGAAAGCTGTTCATTAACGCAGGCAT  >  W3110S.gb/1041635‑1041684

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑