Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1049923	1049961	39	18 [0]	[0] 50	ymcD	hypothetical protein

TTAGCGTGTAGTGGACGTGGTGGTTGAGGTGTTATGAGAACCGCCATCGCCACTGTCATTTG  >  W3110S.gb/1049861‑1049922                                                              | ttAGCGTGTAGTGGACGTGGTGGTTGAGGTGTTATGAGAACCGCCATCGCCACTGTCATTtg  <  1:248554/62‑1 (MQ=255) ttAGCGTGTAGTGGACGTGGTGGTTGAGGTGTTATGAGAACCGCCATCGCCACTGTCATTtg  <  1:953618/62‑1 (MQ=255) ttAGCGTGTAGTGGACGTGGTGGTTGAGGTGTTATGAGAACCGCCATCGCCACTGTCATTtg  <  1:936056/62‑1 (MQ=255) ttAGCGTGTAGTGGACGTGGTGGTTGAGGTGTTATGAGAACCGCCATCGCCACTGTCATTtg  <  1:899426/62‑1 (MQ=255) ttAGCGTGTAGTGGACGTGGTGGTTGAGGTGTTATGAGAACCGCCATCGCCACTGTCATTtg  <  1:866675/62‑1 (MQ=255) ttAGCGTGTAGTGGACGTGGTGGTTGAGGTGTTATGAGAACCGCCATCGCCACTGTCATTtg  <  1:377422/62‑1 (MQ=255) ttAGCGTGTAGTGGACGTGGTGGTTGAGGTGTTATGAGAACCGCCATCGCCACTGTCATTtg  <  1:309869/62‑1 (MQ=255) ttAGCGTGTAGTGGACGTGGTGGTTGAGGTGTTATGAGAACCGCCATCGCCACTGTCATTtg  <  1:309637/62‑1 (MQ=255) ttAGCGTGTAGTGGACGTGGTGGTTGAGGTGTTATGAGAACCGCCATCGCCACTGTCATTtg  <  1:300878/62‑1 (MQ=255) ttAGCGTGTAGTGGACGTGGTGGTTGAGGTGTTATGAGAACCGCCATCGCCACTGTCATTtg  <  1:1004977/62‑1 (MQ=255) ttAGCGTGTAGTGGACGTGGTGGTTGAGGTGTTATGAGAACCGCCATCGCCACTGTCATTtg  <  1:24183/62‑1 (MQ=255) ttAGCGTGTAGTGGACGTGGTGGTTGAGGTGTTATGAGAACCGCCATCGCCACTGTCATTtg  <  1:154361/62‑1 (MQ=255) ttAGCGTGTAGTGGACGTGGTGGTTGAGGTGTTATGAGAACCGCCATCGCCACTGTCATTtg  <  1:1469650/62‑1 (MQ=255) ttAGCGTGTAGTGGACGTGGTGGTTGAGGTGTTATGAGAACCGCCATCGCCACTGTCATTtg  <  1:1234631/62‑1 (MQ=255) ttAGCGTGTAGTGGACGTGGTGGTTGAGGTGTTATGAGAACCGCCATCGCCACTGTCATTtg  <  1:1154333/62‑1 (MQ=255) ttAGCGTGTAGTGGACGTGGTGGTTGAGGTGTTATGAGAACCGCCATCGCCACTGTCATTtg  <  1:1097583/62‑1 (MQ=255) ttAGCGTGTAGTGGACGTGGTGGTTGAGGTGTTATGAGAACCGCCATCGCCACTGTCATTtg  <  1:1072158/62‑1 (MQ=255)  tAGCGTGTAGTGGACGTGGTGGTTGAGGTGTTATGAGAACCGCCATCGCCACTGTCATTtg  <  1:1224710/61‑1 (MQ=255)                                                              | TTAGCGTGTAGTGGACGTGGTGGTTGAGGTGTTATGAGAACCGCCATCGCCACTGTCATTTG  >  W3110S.gb/1049861‑1049922

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑