Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1055206	1055401	196	25 [0]	[0] 40	torS	hybrid sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with TorR

AATCATCACGCTGGGCGTTAAGTGCGGGGTTATCTGCCAGCAGTTGAGC  >  W3110S.gb/1055157‑1055205                                                 | aaTCATCACGCTGGGCGTTAAGTGCGGGGTTATCTGCCAGCTGTTGAGc  >  1:868086/1‑49 (MQ=255) aaTCATCACGCTGGGCGTTAAGTGCGGGGTTATCTGCCAGCAGTTGAGc  >  1:311181/1‑49 (MQ=255) aaTCATCACGCTGGGCGTTAAGTGCGGGGTTATCTGCCAGCAGTTGAGc  >  1:939627/1‑49 (MQ=255) aaTCATCACGCTGGGCGTTAAGTGCGGGGTTATCTGCCAGCAGTTGAGc  >  1:908550/1‑49 (MQ=255) aaTCATCACGCTGGGCGTTAAGTGCGGGGTTATCTGCCAGCAGTTGAGc  >  1:827630/1‑49 (MQ=255) aaTCATCACGCTGGGCGTTAAGTGCGGGGTTATCTGCCAGCAGTTGAGc  >  1:820116/1‑49 (MQ=255) aaTCATCACGCTGGGCGTTAAGTGCGGGGTTATCTGCCAGCAGTTGAGc  >  1:665258/1‑49 (MQ=255) aaTCATCACGCTGGGCGTTAAGTGCGGGGTTATCTGCCAGCAGTTGAGc  >  1:650084/1‑49 (MQ=255) aaTCATCACGCTGGGCGTTAAGTGCGGGGTTATCTGCCAGCAGTTGAGc  >  1:595211/1‑49 (MQ=255) aaTCATCACGCTGGGCGTTAAGTGCGGGGTTATCTGCCAGCAGTTGAGc  >  1:528402/1‑49 (MQ=255) aaTCATCACGCTGGGCGTTAAGTGCGGGGTTATCTGCCAGCAGTTGAGc  >  1:518353/1‑49 (MQ=255) aaTCATCACGCTGGGCGTTAAGTGCGGGGTTATCTGCCAGCAGTTGAGc  >  1:450559/1‑49 (MQ=255) aaTCATCACGCTGGGCGTTAAGTGCGGGGTTATCTGCCAGCAGTTGAGc  >  1:3441/1‑49 (MQ=255) aaTCATCACGCTGGGCGTTAAGTGCGGGGTTATCTGCCAGCAGTTGAGc  >  1:1088064/1‑49 (MQ=255) aaTCATCACGCTGGGCGTTAAGTGCGGGGTTATCTGCCAGCAGTTGAGc  >  1:302523/1‑49 (MQ=255) aaTCATCACGCTGGGCGTTAAGTGCGGGGTTATCTGCCAGCAGTTGAGc  >  1:300154/1‑49 (MQ=255) aaTCATCACGCTGGGCGTTAAGTGCGGGGTTATCTGCCAGCAGTTGAGc  >  1:271010/1‑49 (MQ=255) aaTCATCACGCTGGGCGTTAAGTGCGGGGTTATCTGCCAGCAGTTGAGc  >  1:176615/1‑49 (MQ=255) aaTCATCACGCTGGGCGTTAAGTGCGGGGTTATCTGCCAGCAGTTGAGc  >  1:1467538/1‑49 (MQ=255) aaTCATCACGCTGGGCGTTAAGTGCGGGGTTATCTGCCAGCAGTTGAGc  >  1:1424943/1‑49 (MQ=255) aaTCATCACGCTGGGCGTTAAGTGCGGGGTTATCTGCCAGCAGTTGAGc  >  1:1401216/1‑49 (MQ=255) aaTCATCACGCTGGGCGTTAAGTGCGGGGTTATCTGCCAGCAGTTGAGc  >  1:1374832/1‑49 (MQ=255) aaTCATCACGCTGGGCGTTAAGTGCGGGGTTATCTGCCAGCAGTTGAGc  >  1:129667/1‑49 (MQ=255) aaTCATCACGCTGGGCGTTAAGTGCGGGGTTATCTGCCAGCAGTTGAGc  >  1:1272700/1‑49 (MQ=255) aaTCATCACGCTGGGCGTTAAGTGCGGGGTTATCTGCCAGCAGTTGAGc  >  1:1128402/1‑49 (MQ=255)                                                 | AATCATCACGCTGGGCGTTAAGTGCGGGGTTATCTGCCAGCAGTTGAGC  >  W3110S.gb/1055157‑1055205

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑