Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1092079	1092290	212	70 [0]	[0] 12	ycdS	predicted outer membrane protein

TGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGATT  >  W3110S.gb/1092017‑1092078                                                              | tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:372075/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:473901/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:457390/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:453654/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:446933/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:444498/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:435560/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:409616/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:391953/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:490226/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:365790/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:358984/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:347706/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:345202/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:320133/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:310719/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:1012241/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:708335/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:997176/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:963150/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:90389/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:887222/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:868259/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:854001/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:803092/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:722002/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:305571/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:677501/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:668575/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:612797/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:579267/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:544612/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:530776/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:502215/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:1110393/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:303386/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:1216842/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:1199740/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:1199710/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:119408/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:1180225/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:1155773/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:1141218/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:1230059/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:1109895/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:1090427/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:1070470/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:1061757/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:1056448/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:1042080/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:1040897/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:1414081/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:297898/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:255944/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:236108/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:203562/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:197627/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:189671/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:181648/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:178958/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:141560/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:1244948/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:1387607/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:1384750/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:1365622/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:1313782/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:1308887/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:125387/62‑1 (MQ=255) tGAATATCAGCGCGAATATCAGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:640421/62‑1 (MQ=255)            gcgAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGatt  <  1:668688/51‑1 (MQ=255)                                                              | TGAATATCAGCGCGAATATCTGGCGTTAAATTGGCATCGTCAATCGCGGCAGCAAGTTGATT  >  W3110S.gb/1092017‑1092078

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑