Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1110459	1111069	611	48 [0]	[0] 21	[mdoC]–[mdoG]	[mdoC],[mdoG]

CGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTAACAA  >  W3110S.gb/1110420‑1110458                                       | cGATTAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCACTaacaa  >  1:517581/1‑39 (MQ=38) cGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTaacaa  >  1:560112/1‑39 (MQ=255) cGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTaacaa  >  1:36123/1‑39 (MQ=255) cGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTaacaa  >  1:395292/1‑39 (MQ=255) cGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTaacaa  >  1:412604/1‑39 (MQ=255) cGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTaacaa  >  1:462036/1‑39 (MQ=255) cGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTaacaa  >  1:498994/1‑39 (MQ=255) cGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTaacaa  >  1:511082/1‑39 (MQ=255) cGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTaacaa  >  1:529401/1‑39 (MQ=255) cGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTaacaa  >  1:530796/1‑39 (MQ=255) cGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTaacaa  >  1:541157/1‑39 (MQ=255) cGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTaacaa  >  1:544006/1‑39 (MQ=255) cGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTaacaa  >  1:33232/1‑39 (MQ=255) cGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTaacaa  >  1:567677/1‑39 (MQ=255) cGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTaacaa  >  1:573939/1‑39 (MQ=255) cGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTaacaa  >  1:581987/1‑39 (MQ=255) cGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTaacaa  >  1:686476/1‑39 (MQ=255) cGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTaacaa  >  1:702204/1‑39 (MQ=255) cGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTaacaa  >  1:720607/1‑39 (MQ=255) cGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTaacaa  >  1:812210/1‑39 (MQ=255) cGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTaacaa  >  1:83766/1‑39 (MQ=255) cGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTaacaa  >  1:865130/1‑39 (MQ=255) cGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTaacaa  >  1:954376/1‑39 (MQ=255) cGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTaacaa  >  1:971592/1‑39 (MQ=255) cGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTaacaa  >  1:1372950/1‑39 (MQ=255) cGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTaacaa  >  1:1049880/1‑39 (MQ=255) cGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTaacaa  >  1:1055138/1‑39 (MQ=255) cGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTaacaa  >  1:10653/1‑39 (MQ=255) cGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTaacaa  >  1:112602/1‑39 (MQ=255) cGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTaacaa  >  1:1195757/1‑39 (MQ=255) cGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTaacaa  >  1:1211362/1‑39 (MQ=255) cGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTaacaa  >  1:1254525/1‑39 (MQ=255) cGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTaacaa  >  1:1258373/1‑39 (MQ=255) cGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTaacaa  >  1:1303256/1‑39 (MQ=255) cGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTaacaa  >  1:1319081/1‑39 (MQ=255) cGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTaacaa  >  1:1327393/1‑39 (MQ=255) cGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTaacaa  >  1:1018310/1‑39 (MQ=255) cGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTaacaa  >  1:1388902/1‑39 (MQ=255) cGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTaacaa  >  1:140680/1‑39 (MQ=255) cGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTaacaa  >  1:1435964/1‑39 (MQ=255) cGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTaacaa  >  1:1443800/1‑39 (MQ=255) cGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTaacaa  >  1:197618/1‑39 (MQ=255) cGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTaacaa  >  1:211240/1‑39 (MQ=255) cGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTaacaa  >  1:22750/1‑39 (MQ=255) cGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTaacaa  >  1:244972/1‑39 (MQ=255) cGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTaacaa  >  1:28347/1‑39 (MQ=255) cGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTaacaa  >  1:314858/1‑39 (MQ=255) cGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTaacaa  >  1:324941/1‑39 (MQ=255)                                       | CGAATAGATTAAAGAAATATGAAAAGGTATCCCTAACAA  >  W3110S.gb/1110420‑1110458

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑