Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1220171	1220291	121	33 [0]	[0] 19	ycgG	conserved inner membrane protein

TACTCAGGGCTTTCTTATCTTCATGACCTGCATATTGATTATATC  >  W3110S.gb/1220126‑1220170                                             | tACTCAGGGCTTTCTTATCTTCATGACCTGCATATTGATTATATc  <  1:224257/45‑1 (MQ=255) tACTCAGGGCTTTCTTATCTTCATGACCTGCATATTGATTATATc  <  1:85165/45‑1 (MQ=255) tACTCAGGGCTTTCTTATCTTCATGACCTGCATATTGATTATATc  <  1:751720/45‑1 (MQ=255) tACTCAGGGCTTTCTTATCTTCATGACCTGCATATTGATTATATc  <  1:515058/45‑1 (MQ=255) tACTCAGGGCTTTCTTATCTTCATGACCTGCATATTGATTATATc  <  1:511625/45‑1 (MQ=255) tACTCAGGGCTTTCTTATCTTCATGACCTGCATATTGATTATATc  <  1:487093/45‑1 (MQ=255) tACTCAGGGCTTTCTTATCTTCATGACCTGCATATTGATTATATc  <  1:473295/45‑1 (MQ=255) tACTCAGGGCTTTCTTATCTTCATGACCTGCATATTGATTATATc  <  1:404552/45‑1 (MQ=255) tACTCAGGGCTTTCTTATCTTCATGACCTGCATATTGATTATATc  <  1:402786/45‑1 (MQ=255) tACTCAGGGCTTTCTTATCTTCATGACCTGCATATTGATTATATc  <  1:388481/45‑1 (MQ=255) tACTCAGGGCTTTCTTATCTTCATGACCTGCATATTGATTATATc  <  1:349387/45‑1 (MQ=255) tACTCAGGGCTTTCTTATCTTCATGACCTGCATATTGATTATATc  <  1:348/45‑1 (MQ=255) tACTCAGGGCTTTCTTATCTTCATGACCTGCATATTGATTATATc  <  1:337394/45‑1 (MQ=255) tACTCAGGGCTTTCTTATCTTCATGACCTGCATATTGATTATATc  <  1:326128/45‑1 (MQ=255) tACTCAGGGCTTTCTTATCTTCATGACCTGCATATTGATTATATc  <  1:316329/45‑1 (MQ=255) tACTCAGGGCTTTCTTATCTTCATGACCTGCATATTGATTATATc  <  1:1001493/45‑1 (MQ=255) tACTCAGGGCTTTCTTATCTTCATGACCTGCATATTGATTATATc  <  1:1302604/45‑1 (MQ=255) tACTCAGGGCTTTCTTATCTTCATGACCTGCATATTGATTATATc  <  1:1011301/45‑1 (MQ=255) tACTCAGGGCTTTCTTATCTTCATGACCTGCATATTGATTATATc  <  1:103770/45‑1 (MQ=255) tACTCAGGGCTTTCTTATCTTCATGACCTGCATATTGATTATATc  <  1:1079469/45‑1 (MQ=255) tACTCAGGGCTTTCTTATCTTCATGACCTGCATATTGATTATATc  <  1:1161793/45‑1 (MQ=255) tACTCAGGGCTTTCTTATCTTCATGACCTGCATATTGATTATATc  <  1:1163369/45‑1 (MQ=255) tACTCAGGGCTTTCTTATCTTCATGACCTGCATATTGATTATATc  <  1:1300174/45‑1 (MQ=255) tACTCAGGGCTTTCTTATCTTCATGACCTGCATATTGATTATATc  <  1:164201/45‑1 (MQ=255) tACTCAGGGCTTTCTTATCTTCATGACCTGCATATTGATTATATc  <  1:1328255/45‑1 (MQ=255) tACTCAGGGCTTTCTTATCTTCATGACCTGCATATTGATTATATc  <  1:1331460/45‑1 (MQ=255) tACTCAGGGCTTTCTTATCTTCATGACCTGCATATTGATTATATc  <  1:133565/45‑1 (MQ=255) tACTCAGGGCTTTCTTATCTTCATGACCTGCATATTGATTATATc  <  1:1357160/45‑1 (MQ=255) tACTCAGGGCTTTCTTATCTTCATGACCTGCATATTGATTATATc  <  1:1420726/45‑1 (MQ=255)  aCTCAGGGCTTTCTTATCTTCATGACCTGCATATTGATTATATc  <  1:1167258/44‑1 (MQ=255)  aCTCAGGGCTTTCTTATCTTCATGACCTGCATATTGATTATATc  <  1:554079/44‑1 (MQ=255)  aCTCAGGGCTTTCTTATCTTCATGACCTGCATATTGATTATATc  <  1:1444212/44‑1 (MQ=255)  aCTCAGGGCTTTCTTATCTTCATGACCTGCATATTGATTATATc  <  1:229753/44‑1 (MQ=255)                                             | TACTCAGGGCTTTCTTATCTTCATGACCTGCATATTGATTATATC  >  W3110S.gb/1220126‑1220170

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑