Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1222584	1222593	10	39 [0]	[0] 26	ycgH ycgH	ECK1157:JW5901:b1169; hypothetical protein, N‑ter fragment ECK1157:JW5901+JW5176:b4491; hypothetical protein

CGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCGGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTC  >  W3110S.gb/1222522‑1222583                                                              | cGCACCGTATTAGGTGATGTTAAATCGGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTc  >  1:236920/1‑62 (MQ=255) cGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCGGCTACGGATAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTc  >  1:596004/1‑62 (MQ=255) cGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCGGCTACGGAGAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTc  >  1:1236763/1‑62 (MQ=255) cGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCGGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTc  >  1:696842/1‑62 (MQ=255) cGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCGGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTc  >  1:435070/1‑62 (MQ=255) cGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCGGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTc  >  1:542167/1‑62 (MQ=255) cGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCGGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTc  >  1:614188/1‑62 (MQ=255) cGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCGGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTc  >  1:647271/1‑62 (MQ=255) cGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCGGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTc  >  1:650539/1‑62 (MQ=255) cGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCGGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTc  >  1:65544/1‑62 (MQ=255) cGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCGGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTc  >  1:674095/1‑62 (MQ=255) cGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCGGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTc  >  1:693649/1‑62 (MQ=255) cGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCGGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTc  >  1:399429/1‑62 (MQ=255) cGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCGGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTc  >  1:70196/1‑62 (MQ=255) cGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCGGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTc  >  1:708489/1‑62 (MQ=255) cGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCGGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTc  >  1:738615/1‑62 (MQ=255) cGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCGGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTc  >  1:851161/1‑62 (MQ=255) cGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCGGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTc  >  1:879751/1‑62 (MQ=255) cGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCGGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTc  >  1:885099/1‑62 (MQ=255) cGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCGGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTc  >  1:885473/1‑62 (MQ=255) cGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCGGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTc  >  1:948189/1‑62 (MQ=255) cGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCGGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTc  >  1:1385690/1‑62 (MQ=255) cGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCGGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTc  >  1:1025667/1‑62 (MQ=255) cGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCGGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTc  >  1:1055940/1‑62 (MQ=255) cGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCGGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTc  >  1:1059562/1‑62 (MQ=255) cGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCGGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTc  >  1:1080365/1‑62 (MQ=255) cGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCGGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTc  >  1:1232107/1‑62 (MQ=255) cGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCGGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTc  >  1:125120/1‑62 (MQ=255) cGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCGGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTc  >  1:1278352/1‑62 (MQ=255) cGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCGGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTc  >  1:1304360/1‑62 (MQ=255) cGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCGGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTc  >  1:420137/1‑62 (MQ=255) cGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCGGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTc  >  1:1400096/1‑62 (MQ=255) cGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCGGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTc  >  1:142667/1‑62 (MQ=255) cGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCGGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTc  >  1:186234/1‑62 (MQ=255) cGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCGGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTc  >  1:210061/1‑62 (MQ=255) cGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCGGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTc  >  1:274799/1‑62 (MQ=255) cGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCGGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTc  >  1:323461/1‑62 (MQ=255) cGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCGGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTc  >  1:340568/1‑62 (MQ=255) cGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCGGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTc  >  1:1016996/1‑62 (MQ=255)                                                              | CGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCGGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTC  >  W3110S.gb/1222522‑1222583

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑